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Team:Harvard/ZF Binding Site Finder
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Zinc Finger Binding Site Finder
Zinc Finger Binding Site Finder
by Justin Chew
CTTTGGCTTTTTACATGCCTTGCCCTCTTGCTGAATACTTATTTTCTCTGTTTCCAAATCCAAATAGTGGATAATACTAAGCAATTAACTACTCTCAAGTTTATATATTGTGTGTTCAAAAGACCAGCCAACATTTCTCATTTACATGTTACAGTGACATAATCCAACCCCGAGGGTACACTTACTCTTGAATGAACTGAATAAATTAAAATTTTAAGCTGAAAAAAAATAGGATTTGGTGATTAGATATAAAGGATGAGCGGGAGAGAGGAGTCAAAGCTGGTAAGACAAGAACAAGAAGGAGGAAAAGTTTTTGAGGAAACAGGTAAGTTTTGTTCTGCAGAGACACATCTAAAAAGCTAAGGAACATCCATGTCCAGTTAAGGTCCAAAGTTCCCCAGAGAGGCCTGGGCTATCCAGCTTTAGAAGTCATCTTCCTAAGAAGTAATAATGGACATATTAAAGTAATAATGTTATCAAAGGAGAAGGGATAGGATGAGATGAGAGGGCCAAGAATATATTCTTAGGGATTGACTATTTCTTTAGGAAGCCACCAAAGGAAAGGGATCACTTCAGGGGCCTAAGAAATAGTAACCAAAGAAGCAGGAGACATGGAAGAGATCAATGCTTCAAAAATCTTTCACTGAATTATAATCTAAGATCATGACAATCACAGCAATAATGATAATAAATTCATTGTATGGGCTTTTCTTAAGTCACTTAATACACAATCCTATTGAGGTATATGCTATCTCAATTTTACAGAAGGAATTAGAGGCACAGAAAGGTAATGTTATCTGCCCAATGTTATCTATCCAGGAGGGCAGGAAACAGCTGGCTCTGCAGTCCATGCTTTTAGTAATTTTTGTTTGTTTTTTGACAGGGTCTTACTCTGCTGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCATGAACACTGTTCACTGCAGCCTCGACCTCCTGAGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACTATGCAGGCTAATTTTAAAATTTGTTGAGATGGATTCTCGTTGCATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTTCTGGTCTAAAATGAACCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAAGTGGTGAGATTATAGGCATAAGCCACTGCACCAGGCTAGTGATTGCTAACACTTAAATAGCACTTCCAAGTGCCTTGACACTTTTCTAAACACTTTGTATTCACTAATTCGTGTAATTCTCACTATAGTTTTTTAAGGTAAATACTATCGTTATCTCCATTTTATAGATGAGGAAACTGAGGAACAGGAAGATCATATAAACTGCCCAAGGTCATAGATGTGGAACATTCTGAACTAACACCAGACTATTGGGCCCTATGGTGGTGCTCAGATGTTACTTGGAAAGTATAATGCTCACAGAAGCACTCTCTCTCTCTAGGGGAATACTTGTTTCCATCATTTGTTTTACTCTCTGTAGAGGGAAACATTCCTTTCCAAAGGAGATTTCATCTTCTGACTAGTAAATCAGACTCAGAATGAGCTATGATTCATTTACAGGTAAGTCACAAGCTTTATTCCTGGCCAGATAAGAAATCAGTAATTTGGTTTTGTCTGAAGAGATTTGGGAATTCCCCCAAGATGATTTCCTGGAGTGGGTCAGAATGCCACCTACACACTAGGTTAATGACTTCAGTGTTCTGCTTGGTTCGCTGATGACAGGAAACTGGTAAAACAAAGAGGGTGAGAAACCAGCTGTATCACAGTAATAAATATTACTCAGATTTAGGCTCTTCTTCCTAGTTCCTGAGTTTTTTTAACTTTCAAGCTTTCACTCAGACAATATGCAATGATTAGCTAATACAGTTTGTTTTAGTATTACAAATGATGATGGCAGATTTTGCGGGGAATTTGTTTTAAAGTTAATGTTATCATATTTTTACAATTCTTGTTTTCAATAGTTTGAAAAAGTTCTGTTGGGATCCTGAATTCTTAATTTTGACTGAGATCTAGTGAGATTAGTTGTCTCTTTTGGAGATAATTTTAGAGGCATAAAAATGGTAAATCAATTTTTTTTCAATTATTAGAAATCATGTGCACAAAATAGTCAAGGGGAAAGATTAGCAACTGCTTTTTTAATATAGCATTAATTGATTTCACAAATAGTTACTATGCTGCTACTGTATTTTTTAGGCATCAGAGATAGAGTTGTGAGGAAGACAAGGCAAGATCCTTGACCTCCAAATGTTTATAGTCTAGCAAGATAAATTAATAAATATATAATTAAGTAATAGGTAATGATAAATTCTATAAAGAAAAATTAACCAGGTGAAGGAGATAGAGAATAATGGAAGCAAATCAGAATTAAAATAGGAATTTCAGAGAAGGCCTCTTTGAGGTTTTATTGTTATTGTGATAGAAAGTTTCATGGCTCTGATTTTACCGTTTTAAAACGTAACTCTAGCTACAAGGAGAAAAGACTGTATTTATGGGAGCAAGTGTAGAATCAGGAACACCAGTTAAGAGTCTATTATAATAGTCTAGGTTCTCAACCTTGTCTGCTGCTTAGAATTCCCTGGAGATAATTTTAGCCAGCCCCAGTTGAAACCAGTTACTATATGTCAAAATCTTTGAGAGTAGAGTCCAGGAGTTGATATTTCTCAAGGTTCCTCTGGTGATTTTAATATATAGCCAAGGTTGGAAAAGGTTGTGGAAGAAAGATATCAGACAACAAGTCTAGGGCAGTTTTCTAAATCTAGTAGGAACACGGAAGCTGTTAAAACAGGACTGGCTTCTTTTCTGGATTTATTTTCTTCTTTAAGGAATATGGTTAGGTCAGAGAACAAAGCAAATTCTTAAAGAGGAAAACATTTATCAGGAAATGATGAAGATGGATTTTGGCTAAGAAGCATTAACTAATATACTACTAGGAAGCAGTGGTAAATGAAAATGTTTGTCATGTTTGTTTCTTCAAATATTCTAGTATGGAGTCCATGGATGAAAATGTTTGTGAAAGGATGATGTAGGAGACTGGGTCTCTAGCAGTTATCTATGGAGGTGGCTAGATGTCAGATTCAGGATTTATACATTTTGTAGAGATAGCAATTAAGATTCACTGATGGATTGGAAGTGGGATGATAGGGAAAGGGGGGTCAGGGATGACATCCAAATTTTAGGCCTGAGCAATTGGGTGAATTGTTGCATTTATTTCGTTGGGGGAAAGTGGGTGGAAAAGTAGGGAATATCTGTGTGGGGGAGGAGGTCGAATATTGAAATTAAGAATATCAGTTTGGACTTCATAATGTAAAGAGTGCTAATTAAACTCTAAAATGAATGTAAGTAGAGAGTGAGATATAGATTCACAATTTGAATGATTTGTTTCCTGGAATAATTTTCTTTGATTTTATGTCTGTTTATTGTTTGAATAACTAGGGAACTTATTTACTTTTATCTCATTTATTTTTTATCTTCCTAGATTTTTAATGTATACCCTACTACATTGCATATAGGCATGGTAGAAGAGTGTTTTAAGACTATGCTAACCTTTACTCCAATAAAACATTATAATTTTGTAAACTGTAGTCCTAATAGACTGCTGGGGAAGAGCAATAACACATAAATGCATGAACATTTTAGTGTTAAAAACATTGCAAAATTATAAGTTTTAAAAAATGGATTAAAAGATAACTAATGAAATTTTAGAACATCACTTCCAAAACTTTCTTCACTATAGAACAGTTTAAAATTCTAATATATTGATGAAAACCAAAAAGAACTCAACAGATTTAATGGGCTCTTGAATTAAAGTAGATAGCAAAAAATGGACTTTTAGACAGATTAGTCACTACAAGAGAGAATCATTTATCATGTGTATAAAATACAATGAATTTTAAATAACATAGCTCTATGTTGAAATTATAAGAAAATACATAAATTAGACAAATATATATCACTTATTCAAATTCAATTGTAATCTCAAGTATAATATCAATTGTAATATCAAAATGTCATTAACTGGAAAATAATACTAATAGCTAAAGTGTATTGAGCATTTACAATGACTAAGAACAATTCCAAGCATTTTACAAAATATGTTAACTCAGTTAAGGAATACTCTTAGCTACAAGTGACAGTATTTAATATTGGTCACTTAAAAACCTATGGTTCATTGCTTTTCATGTTAAAAGGAGTCTGGAAACTGGCATTGGTTCAGTGACACAATGGTTTCTCATAGCATCTACATTGCTCTCTTGGCCTCATCCTCTTGGTTGCAAGATGTCACTCCCAGGTCCAGGAAGCATGTTTGTGTTAAAGACAAGAAAAAGGAAGGAAAGGATGGACCTGGGTACATCTGTCTCTTTTTATCAGGAAAGCCAAAGCTTTCCTAGAAGCTCCAACAGATTTCTGCTTAGGTCTCCTCTGCTGGCACTATTACTTAGCACCCCTAGTTGCAAGGGAGGCTGGGAAATCAGGTATGACATTTTTTTTCTGCCTTTATAGAGGAACAGGAGAAAGGAAAAGAAGGTTGAGAATGGGTTTTGAATTAGGCAGCCAACAGTGACTGCCACAAATTCATGTCTTTCTTATGAAAGCCCTATCAAAGTGGTACTTTTGTTTATTACCATTTTGCAAATGAGAAACTAAGAGTGAGAAGTTAAGAAATTTGACCATGGTCACACAACTAAATAATGTAGAACCAGAAATCGAGTCAGGTGGTCTGTCTGTCTCCAGAATCTGCTCTCTTCTCAGCCACTCTACTATAGTATAGAAATAAAGCCACAGACAGATTTAACACTGAGCCTTCTCATGTGAGTGATCTTCCATATAACTTCCTTACATTCTCATGAATGATACATTTATTATAATAGGCAATACATTACCTAATGATAAAACTAAATAAATGCGTGCTATTGCTCTTATTCTTTCTAATTATACCAATAATAATAAACCACATGGTTAATTTGAATTTGTAAAGTCACCCTTTCAAACAATTGTAAGTATTTTC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Bottom Zinc Finger Array:
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Top Zinc Finger Array:
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Nucleotide Gap:
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