Team:Arizona State/Templates/cas table

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| || cas_HTH ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  
| || cas_HTH ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  
|-
|-
-
|cas1 || cas1 || cas1 || y || y || y || y || y || y || y || y || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1518}} || ||  ||  || Nuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}} ||  
+
|cas1 || cas1 || cas1 || y || y || y || y || y || y || y || y || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1518}} || 00287 ||  ||  || Nuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}} ||  
|-
|-
-
|cas10 || cmr2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} || ||  || y || Polymerase {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}} ||  
+
|cas10 || cmr2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} || 02577 ||  || y || Polymerase {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}} ||  
|-
|-
-
|cas10 || csm1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} || ||  || y || Polymerase {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}} ||  
+
|cas10 || csm1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} || 02578 ||  || y || Polymerase {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}} ||  
|-
|-
|cas10 || csx11 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} ||  ||  || y || Polymerase {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}} ||  
|cas10 || csx11 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} ||  ||  || y || Polymerase {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}} ||  
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|cas10d || csc3 ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} ||  ||  || y ||  ||  
|cas10d || csc3 ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} ||  ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|cas2 || cas2 || cas2 || y || y || y || y || y || y || y || y || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1343}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3512}} || ||  ||  ||  ||  
+
|cas2 || cas2 || cas2 || y || y || y || y || y || y || y || y || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1343}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3512}} || 01573 ||  ||  ||  ||  
|-
|-
-
|cas3' || cas3 || cas3 || y || y || y || y || y || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1203}} || ||  ||  || Helicase, nuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
+
|cas3' || cas3 || cas3 || y || y || y || y || y || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1203}} || 01587 ||  ||  || Helicase, nuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|-
|-
|cas3'' ||  ||  || y || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|2254}} ||  ||  ||  ||  ||  
|cas3'' ||  ||  || y || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|2254}} ||  ||  ||  ||  ||  
|-
|-
-
|cas4 || cas4 ||  || y || y || y || y ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1468}} || ||  ||  || RecB exonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}}{{:Team:Arizona State/Templates/ref|73}} ||  
+
|cas4 || cas4 ||  || y || y || y || y ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1468}} || 00372 ||  ||  || RecB exonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}}{{:Team:Arizona State/Templates/ref|73}} ||  
|-
|-
-
|cas4 || csa1 ||  || y || y || y || y ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1468}} || ||  ||  || RecB exonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}}{{:Team:Arizona State/Templates/ref|73}} ||  
+
|cas4 || csa1 ||  || y || y || y || y ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1468}} || 01896 ||  ||  || RecB exonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|72}}{{:Team:Arizona State/Templates/ref|73}} ||  
|-
|-
-
|cas5 || cas5d || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
+
|cas5 || cas5d || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || 01876 || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|-
|-
-
|cas5 || cas5e || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
+
|cas5 || cas5e || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || 01868 || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|-
|-
-
|cas5 || cas5h || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
+
|cas5 || cas5h || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || 02592 || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|-
|-
-
|cas5 || cas5t || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
+
|cas5 || cas5t || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || 01895 || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|-
|-
|cas5 || cmx5 || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} ||  || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|cas5 || cmx5 || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} ||  || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|-
|-
-
|cas5 || csa5a || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
+
|cas5 || csa5a || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} || 01874 || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|-
|-
|cas5 || csa5p || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} ||  || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|cas5 || csa5p || casD || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1688}} ||  || y || y || N-terminal domain {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}}, crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas5
|-
|-
-
|cas6 || cas6 ||  || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1583}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|5551}} || || y ||  || crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas6
+
|cas6 || cas6 ||  || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1583}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|5551}} || 01877 || y ||  || crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas6
|-
|-
|cas6 || cmx6 ||  || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1583}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|5551}} ||  || y ||  || crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas6
|cas6 || cmx6 ||  || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1583}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|5551}} ||  || y ||  || crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas6
|-
|-
-
|cas6e || cse3 || casE ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || || y ||  || crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas6
+
|cas6e || cse3 || casE ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 01907 || y ||  || crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas6
|-
|-
-
|cas6f || csy4 ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || || y ||  || crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas6
+
|cas6f || csy4 ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 02563 || y ||  || crRNA processing {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} || cas6
|-
|-
-
|cas7 || csa2 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
+
|cas7 || csa2 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || 02583 || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
|-
|-
-
|cas7 || csd2 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
+
|cas7 || csd2 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || 02589 || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
|-
|-
-
|cas7 || cse4 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
+
|cas7 || cse4 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || 01869 || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
|-
|-
-
|cas7 || csh2 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
+
|cas7 || csh2 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || 02590 || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
|-
|-
|cas7 || csp1 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} ||  || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
|cas7 || csp1 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} ||  || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
|-
|-
-
|cas7 || cst2 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
+
|cas7 || cst2 || casC || y || y || y ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1857}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3649}} || 02585 || y || y || Regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} || cas7
|-
|-
|cas8a1 || CXXC-CXXC ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|cas8a1 || CXXC-CXXC ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
Line 83: Line 83:
|cas8a1 || cmx1 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|cas8a1 || cmx1 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|cas8a1 || cst1 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|cas8a1 || cst1 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 01908 ||  || y ||  ||  
|-
|-
|cas8a1 || csx13 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|cas8a1 || csx13 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
Line 89: Line 89:
|cas8a1 || csx8 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|cas8a1 || csx8 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|cas8a2 || csa4 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|cas8a2 || csa4 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 01914 ||  || y ||  ||  
|-
|-
|cas8a2 || csx9 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|cas8a2 || csx9 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
Line 95: Line 95:
|cas8b || TM1802 ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|cas8b || TM1802 ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|cas8b || csh1 ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|cas8b || csh1 ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 02591 ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|cas8c || csd1 ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|cas8c || csd1 ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 01863 ||  || y ||  ||  
|-
|-
|cas8c || csp2 ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|cas8c || csp2 ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|cas9 || csn1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3513}} || ||  ||  || HNH endonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
+
|cas9 || csn1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3513}} || 01865 ||  ||  || HNH endonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|-
|-
|cas9 || csx12 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3513}} ||  ||  ||  || HNH endonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|cas9 || csx12 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y || y ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3513}} ||  ||  ||  || HNH endonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|-
|-
-
|cmr1 || cmr1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1367}} || || y || y ||  || cas7
+
|cmr1 || cmr1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1367}} || 01894 || y || y ||  || cas7
|-
|-
-
|cmr3 || cmr3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1769}} || || y || y ||  || cas5
+
|cmr3 || cmr3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1769}} || 01888 || y || y ||  || cas5
|-
|-
-
|cmr4 || cmr4 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1336}} || || y || y ||  || cas7
+
|cmr4 || cmr4 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1336}} || 02580 || y || y ||  || cas7
|-
|-
-
|cmr5 || cmr5 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3337}} || ||  || y ||  ||  
+
|cmr5 || cmr5 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|3337}} || 01881 ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|cmr6 || cmr6 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1604}} || || y || y ||  || cas7
+
|cmr6 || cmr6 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1604}} || 01898 || y || y ||  || cas7
|-
|-
-
|csa5 || csa5 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|csa5 || csa5 ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 01878 ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|csaX || csaX ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  || ||  ||  ||  ||  
+
|csaX || csaX ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  || 03876 ||  ||  ||  ||  
|-
|-
|csb1 || GSU0053 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  
|csb1 || GSU0053 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  
Line 129: Line 129:
|csc2 || csc2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1337}} ||  || y || y ||  || cas7
|csc2 || csc2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1337}} ||  || y || y ||  || cas7
|-
|-
-
|cse1 || cse1 || casA ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|cse1 || cse1 || casA ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 02547 ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|cse2 || cse2 || casB ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|cse2 || cse2 || casB ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 02548 ||  || y ||  ||  
|-
|-
|csf1 || csf1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  
|csf1 || csf1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  
Line 141: Line 141:
|csf4 || csf4 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  
|csf4 || csf4 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  
|-
|-
-
|csm2 || csm2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|csm2 || csm2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  || 01870 ||  || y ||  ||  
|-
|-
|csm3 || csc2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1337}} ||  || y || y ||  || cas7
|csm3 || csc2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1337}} ||  || y || y ||  || cas7
Line 147: Line 147:
|csm3 || csm3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1337}} ||  || y || y ||  || cas7
|csm3 || csm3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1337}} ||  || y || y ||  || cas7
|-
|-
-
|csm4 || csm4 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1567}} || || y || y ||  || cas5
+
|csm4 || csm4 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1567}} || 01903 || y || y ||  || cas5
|-
|-
-
|csm5 || csm5 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1332}} || || y || y ||  || cas7
+
|csm5 || csm5 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1332}} || 01899 || y || y ||  || cas7
|-
|-
|csm6 || APE2256 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}} ||  ||  ||  || transctiption regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} ||  
|csm6 || APE2256 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}} ||  ||  ||  || transctiption regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} ||  
|-
|-
-
|csm6 || csm6 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}} || ||  ||  || transctiption regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} ||  
+
|csm6 || csm6 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}} || 02672 ||  ||  || transctiption regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|62}} ||  
|-
|-
-
|csn2 || csn2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  ||  ||  ||  
+
|csn2 || csn2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 01866 ||  ||  ||  ||  
|-
|-
|csx1 || DXTHG ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|4006}} ||  ||  ||  || Helix-turn-helix, transcription regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|csx1 || DXTHG ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|4006}} ||  ||  ||  || Helix-turn-helix, transcription regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
Line 163: Line 163:
|csx1 || TIGR02710 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|4006}} ||  ||  ||  || Helix-turn-helix, transcription regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|csx1 || TIGR02710 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|4006}} ||  ||  ||  || Helix-turn-helix, transcription regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|-
|-
-
|csx1 || csa3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|4006}} || ||  ||  || Helix-turn-helix, transcription regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
+
|csx1 || csa3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|4006}} || 01884 ||  ||  || Helix-turn-helix, transcription regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|-
|-
|csx1 || csx1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|4006}} ||  ||  ||  || Helix-turn-helix, transcription regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
|csx1 || csx1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1517}}, {{:Team:Arizona State/Templates/cog|4006}} ||  ||  ||  || Helix-turn-helix, transcription regulation {{:Team:Arizona State/Templates/ref|13}} ||  
Line 181: Line 181:
|csx3 || csx3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  
|csx3 || csx3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  
|-
|-
-
|csy1 || csy1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  ||  
+
|csy1 || csy1 ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 02564 ||  || y ||  ||  
|-
|-
-
|csy2 || csy2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || || y || y ||  || cas5
+
|csy2 || csy2 ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 02565 || y || y ||  || cas5
|-
|-
-
|csy3 || csy3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || ||  || y ||  || cas7
+
|csy3 || csy3 ||  ||  ||  ||  ||  ||  || y ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  ||  || 02566 ||  || y ||  || cas7
|-
|-
|}
|}

Revision as of 19:26, 10 August 2011

Name [62] Name [13] Name[23] I-A I-B I-C I-D I-E I-F II-A II-B III-A III-B I-U III-U U COG TIGR Ramp [62] cascade-like complex [62] putative function grouping [71]
cas_HTH
cas1 cas1 cas1 y y y y y y y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1518 1518] 00287 Nuclease [72]
cas10 cmr2 y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1353 1353] 02577 y Polymerase [72]
cas10 csm1 y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1353 1353] 02578 y Polymerase [72]
cas10 csx11 y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1353 1353] y Polymerase [72]
cas10d csc3 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1353 1353] y
cas2 cas2 cas2 y y y y y y y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1343 1343], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3512 3512] 01573
cas3' cas3 cas3 y y y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1203 1203] 01587 Helicase, nuclease [13]
cas3 y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG2254 2254]
cas4 cas4 y y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1468 1468] 00372 RecB exonuclease [72][73]
cas4 csa1 y y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1468 1468] 01896 RecB exonuclease [72][73]
cas5 cas5d casD y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1688 1688] 01876 y y N-terminal domain [13], crRNA processing [62] cas5
cas5 cas5e casD y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1688 1688] 01868 y y N-terminal domain [13], crRNA processing [62] cas5
cas5 cas5h casD y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1688 1688] 02592 y y N-terminal domain [13], crRNA processing [62] cas5
cas5 cas5t casD y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1688 1688] 01895 y y N-terminal domain [13], crRNA processing [62] cas5
cas5 cmx5 casD y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1688 1688] y y N-terminal domain [13], crRNA processing [62] cas5
cas5 csa5a casD y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1688 1688] 01874 y y N-terminal domain [13], crRNA processing [62] cas5
cas5 csa5p casD y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1688 1688] y y N-terminal domain [13], crRNA processing [62] cas5
cas6 cas6 y y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1583 1583], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG5551 5551] 01877 y crRNA processing [62] cas6
cas6 cmx6 y y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1583 1583], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG5551 5551] y crRNA processing [62] cas6
cas6e cse3 casE y 01907 y crRNA processing [62] cas6
cas6f csy4 y 02563 y crRNA processing [62] cas6
cas7 csa2 casC y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1857 1857], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3649 3649] 02583 y y Regulation [13] cas7
cas7 csd2 casC y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1857 1857], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3649 3649] 02589 y y Regulation [13] cas7
cas7 cse4 casC y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1857 1857], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3649 3649] 01869 y y Regulation [13] cas7
cas7 csh2 casC y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1857 1857], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3649 3649] 02590 y y Regulation [13] cas7
cas7 csp1 casC y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1857 1857], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3649 3649] y y Regulation [13] cas7
cas7 cst2 casC y y y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1857 1857], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3649 3649] 02585 y y Regulation [13] cas7
cas8a1 CXXC-CXXC y y
cas8a1 cmx1 y y
cas8a1 cst1 y 01908 y
cas8a1 csx13 y y
cas8a1 csx8 y y
cas8a2 csa4 y 01914 y
cas8a2 csx9 y y
cas8b TM1802 y y
cas8b csh1 y 02591 y
cas8c csd1 y 01863 y
cas8c csp2 y y
cas9 csn1 y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3513 3513] 01865 HNH endonuclease [13]
cas9 csx12 y y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3513 3513] HNH endonuclease [13]
cmr1 cmr1 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1367 1367] 01894 y y cas7
cmr3 cmr3 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1769 1769] 01888 y y cas5
cmr4 cmr4 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1336 1336] 02580 y y cas7
cmr5 cmr5 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG3337 3337] 01881 y
cmr6 cmr6 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1604 1604] 01898 y y cas7
csa5 csa5 y 01878 y
csaX csaX y 03876
csb1 GSU0053 y y
csb2 y y
csb3 y y
csc1 csc1 y y cas5
csc2 csc2 [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1337 1337] y y cas7
cse1 cse1 casA y 02547 y
cse2 cse2 casB y 02548 y
csf1 csf1 y
csf2 csf2 y y cas7
csf3 csf3 y y
csf4 csf4 y
csm2 csm2 y 01870 y
csm3 csc2 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1337 1337] y y cas7
csm3 csm3 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1337 1337] y y cas7
csm4 csm4 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1567 1567] 01903 y y cas5
csm5 csm5 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1332 1332] 01899 y y cas7
csm6 APE2256 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1517 1517] transctiption regulation [62]
csm6 csm6 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1517 1517] 02672 transctiption regulation [62]
csn2 csn2 y 01866
csx1 DXTHG y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1517 1517], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG4006 4006] Helix-turn-helix, transcription regulation [13]
csx1 NE0113 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1517 1517], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG4006 4006] Helix-turn-helix, transcription regulation [13]
csx1 TIGR02710 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1517 1517], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG4006 4006] Helix-turn-helix, transcription regulation [13]
csx1 csa3 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1517 1517], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG4006 4006] 01884 Helix-turn-helix, transcription regulation [13]
csx1 csx1 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1517 1517], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG4006 4006] Helix-turn-helix, transcription regulation [13]
csx1 csx2 y [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG1517 1517], [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=COG4006 4006] Helix-turn-helix, transcription regulation [13]
csx10 csx10 y y
csx14 y
csx15
csx16 VVA1548 y
csx17 y
csx3 csx3 y
csy1 csy1 y 02564 y
csy2 csy2 y 02565 y y cas5
csy3 csy3 y 02566 y cas7
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