Team:Arizona State/Templates/cas table

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Name [65] Name [15] Name[25] I-A I-B I-C I-D I-E I-F II-A II-B III-A III-B I-U III-U U COG TIGR Ramp [65] cascade-like complex [65] putative function grouping [75]
cas_HTH
cas1 cas1 cas1 y y y y y y y y y y 1518 00287 Nuclease [65]
cas10 cmr2 y y 1353 02577 y Polymerase [65]
csm1 y y 02578 y
csx11 y y y
cas10d csc3 y y
cas2 cas2 cas2 y y y y y y y y y y 1343, 3512 01573
cas3' cas3 cas3 y y y y y y 1203 01587 Helicase, nuclease [15]
cas3 y y 2254
cas4 cas4 y y y y y 1468 00372 RecB exonuclease [65][8]
csa1 y y y y y 01896
cas5 cas5d casD y y y y 1688 01876 y y N-terminal domain [15], crRNA processing [65] cas5
cas5e y y y y 01868 y y cas5
cas5h y y y y 02592 y y cas5
cas5t y y y y 01895 y y cas5
cmx5 y y y y y y cas5
csa5a y y y y 01874 y y cas5
cas6 cas6 y y y y y 1583, 5551 01877 y crRNA processing [65] cas6
cmx6 y y y y y y cas6
cas6e cse3 casE y 01907 y cas6
cas6f csy4 y 02563 y cas6
cas7 csa2 casC y y y y 1857, 3649 02583 y y Regulation [15] cas7
csd2 y y y y 02589 y y cas7
cse4 y y y y 01869 y y cas7
csh2 y y y y 02590 y y cas7
cst2 y y y y 02585 y y cas7
cas8a1 CXXC-CXXC y y
cmx1 y y
cst1 y 01908 y
csx13 y y
csx8 y y
cas8a2 csa4 y 01914 y
csx9 y y
cas8b TM1802 y y
csh1 y 02591 y
cas8c csd1 y 01863 y
csp2 y y
cas9 csn1 y y 3513 01865 HNH endonuclease [15]
csx12 y y
cmr1 cmr1 y 1367 01894 y y cas7
cmr3 cmr3 y 1769 01888 y y cas5
cmr4 cmr4 y 1336 02580 y y cas7
cmr5 cmr5 y 3337 01881 y
cmr6 cmr6 y 1604 01898 y y cas7
csa5 csa5 y 01878 y
csaX csaX y 03876
csb1 GSU0053 y y
csb2 y y
csb3 y y
csc1 csc1 y y cas5
csc2 csc2 1337 y y cas7
cse1 cse1 casA y 02547 y
cse2 cse2 casB y 02548 y
csf1 csf1 y
csf2 csf2 y y cas7
csf3 csf3 y y
csf4 csf4 y
csm2 csm2 y 01870 y
csm3 csc2 y 1337 y y cas7
csm3 y y y cas7
csm4 csm4 y 1567 01903 y y cas5
csm5 csm5 y 1332 01899 y y cas7
csm6 APE2256 y 1517 transcription regulation [65]
csm6 y 02672
csn2 csn2 y 01866
csx1 DXTHG y 1517, 4006 Helix-turn-helix, transcription regulation [15]
NE0113 y
TIGR02710 y
csa3 y 01884
csx1 y
csx2 y
csx10 csx10 y y
csx14 y
csx15
csx16 VVA1548 y
csx17 y
csx3 csx3 y
csy1 csy1 y 02564 y
csy2 csy2 y 02565 y y cas5
csy3 csy3 y 02566 y cas7