Team:KIT-Kyoto/Notebook/LabNote/GFPMLF8J

(Difference between revisions)

Home > Notebook > Lab Note > August	Language：English/Japanese

８月２２日

Member

吉村、中川、松浪

BBa_E0240のトランスフォーメーションをした。

Results

コロニーの生育がみられた。

８月２３日

Member

吉村、中川

1.BBa_E0240のプレカルチャー

2.BBa_E0240からATG GFPを作るためのプライマー設計

Results

1.全てのサンプルに大腸菌の増殖がみられた。

2.以下のように設計した。

F: 3' TTGAATTCTTTCTAGATTCGTAAAGGAGAAGAA

　　　　　 EcoRⅠ↑　　　XbaⅠ↑

Tm値:67.75°C　　33塩基

R: 5' AAACTGCAGAAAACTAGTTTTTTATTATTTGTATAG

　　　　　 　 PstⅠ↑　　　SpeⅠ↑

Tm値:67.66°C　　36塩基

８月２４日

Member

吉村、中川

Purpose

BBa_E0240のアルカリミニプレップ

BBa_E0240のアガロース電気泳動

Method

BBa_E0240のアルカリミニプレップをした後、下表に従って、30分37℃で制限酵素処理を行った。

ddH2O	2 µl
BBa_E0240	50 µl
EcoRⅠ	1 µl
PstⅠ	1 µl
10 x H Buffer	6 µl
	total 60 µl

制限酵素処理後、100 V 30minでアガロース電気泳動行った。

Results

泳動後の写真

800bpあたりにバンドが出ていた。

８月２５日

Member

吉村、中川

Purpose

PCR(23日に作製したプライマーを用いた)

アガロース電気泳動(PCR産物の増幅確認)

Method

以下の条件でPCRを行った。

PCR条件 10 µM GFP Primer F 1.5 µl 10 µM GFP Primer R 1.5 µl BBa_E0240 1 µl 10 x PCR Buffer for KOD Plus 5 µl dNTPs 4 µl MgSO4 4 µl ddH2O 32 µl KOD Plus 1 µl   total 50 µl

Cycle条件 Pre-Denature 95°C 30sec   Denature 95°C 30sec 30 Cycle Anneling 50°C 1min Extension 68°C 1min End 4°C keep

PCR産物が増幅していることを確認するため、アガロース電気泳動を行った。

PCR産物の増幅を確認した後、下表に従ってPCR産物の制限酵素処理を行った。(37°C、overnight)

ddH2O	2 µl
BBa_E0240	50 µl
EcoRⅠ	1 µl
PstⅠ	1 µl
10 x H Buffer	6 µl
	total 60 µl

Results

泳動後の写真

800bpあたりにバンドが見られ、PCR産物の増幅が確認できた。

８月２６日

Member

中川

Purpose

1.ゲルからのDNA抽出

2.pSB1C3のトランスフォーメーション

Results

1.ゲル切り出し後の写真

濃度は510 ng/µlだった。

2.小さいが、コロニーが生えていた。念のために、翌日再度トランスフォーメーションをする。

８月２７日

Member

吉村

Purpose

pSB1C3のトランスフォーメーション

Results

小さいコロニーの生育がみられた。

８月２９日

Member

吉村、中川

Purpose

pSB1C3のプレカルチャー(6サンプル)

Results

6サンプルのうち3サンプルは培養に成功した。

3サンプルはコンタミの可能性があるため、念を入れて翌日もプレカルチャーを行うことにした。

８月３０日

Member

中川

Purpose

1.pSB1C3のプレカルチャー(6サンプル)

2.プライマーの再設計

Results

1.コンタミすることなく培養に成功した。

2.以下のように設計した。

F: 3' TTGAATTCTTTTCTAGATTTCGTAAAGGAGAAGAA

　　　　　 　 EcoRⅠ↑　 　XbaⅠ↑

Tm値:68.8゜C　　35塩基

８月３１日

Member

中川

Purpose

1.pSB1C3のアルカリミニプレップ

2.pSB1C3のアガロース電気泳動

Method
フェノールクロロホルム処理をした後、下表に従って、30分37℃で制限酵素処理を行った。

ddH2O	2 µl
BBa_E0240	50 µl
EcoRⅠ	1 µl
PstⅠ	1 µl
10 x H Buffer	6 µl
	total 60 µl

制限酵素処理後、100 V 30minで電気泳動を行った。
Results

泳動後の写真

</div>