Team:KIT-Kyoto/matsunami/9月
From 2011.igem.org
9月12日(月)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】←ぷろとこるのテーブルをコピペする!!
(1)PCR反応液の調製
<1本分あたり>
KOD+ polymelase 1 µL
10 x Buffer 2 µL
dNTP(2.0 µM) 5 µL
F primer(10 µM) 1.5 µL
R primer(10 µM) 1.5 µL
Templet DNA 1 µL
milliQ 33 µL
上記の分量を混合した。
*<プライマーの塩基配列>
・DIAP2
F primer : Tm値
GCTTCTCGATTGACGGAGCTGGGCATGGAGCT 62 ℃
R primer :
GCCGTCTAGATCACGAAAGGAACGTGCGCA 66.4 ℃
増幅サイズ 約1514 bp
(2)PCR反応条件
<1>×1 Pre-denature 94 ℃ 2 min
<2>×35 Denature 94 ℃ 15 sec
Annealing 50.5 ℃ 30 sec
Extension 68 ℃ 1 min 40 sec
<3> 4℃ ∞
上記の条件でPCRを行った。
9月13日(火)
松浪、横井川
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
9月14日(水)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】
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*プライマーの塩基配列
・API2-MALT1
F primer
GCCGCTCGAGAACATAGTAGAAAACAGCAT
Tm値
57.8 ゜C
R primer
GCCGGCTAGCTCATTTTTCAGAAATTCTGA
Tm値
56.5 ゜C
増幅サイズ 約3131 bp
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
9月15日(木)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験方法】
以下の条件でPCRを行った。
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各サンプルを回収し、-20゜Cで保存した。
*<プライマーの塩基配列>
・DIAP2
F primer : Tm値
GCTTCTCGATTGACGGAGCTGGGCATGGAGCT 62 ℃
R primer :
GCCGTCTAGATCACGAAAGGAACGTGCGCA 66.4 ℃
増幅サイズ 約1514 bp
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
【目的】
PCR産物の制限酵素処理
【実験操作】
↓PCR産物を400 µlまでddH2Oで薄めた。
↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした。
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。
↓水層のみを新しいチューブに移した。
↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした。
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。
↓水層のみを新しいチューブに移した。
↓3M CH3COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した。
↓15000rpm、4°Cで10min遠心した。
↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた。
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した。
↓上澄みを捨て、乾燥させた。
↓ddH2Oを44 µl加えてvoltexした。
下記の組成に従って反応液を調整した。
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9月16日(金)
松浪、横井川
【目的】
PCR産物の制限酵素処理
【実験操作】
↓PCR産物を400 µlまでddH2Oで薄めた。
↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした。
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。
↓水層のみを新しいチューブに移した。
↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした。
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。
↓水層のみを新しいチューブに移した。
↓3M CH3COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した。
↓15000rpm、4°Cで10min遠心した。
↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた。
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した。
↓上澄みを捨て、乾燥させた。
↓ddH2Oを44 µl加えてvoltexした。
下記の組成に従って反応液を調整した。