Team:KIT-Kyoto/nakagawa9月2

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GFPのゲル抽出<BR>
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<a herf="http://www.qiagen.com/products/dnacleanup/gelpcrsicleanupsystems/qiaquickgelextractionkit.aspx">QIAquick Gel Extraction Kit</a>を使用してゲルからGFPのDNAを抽出した。<BR>
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その後吸光度計を使って濃度の測定をした。<BR>
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<tr><td><table border=1 width="160px">
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<tr><td width="70px" align=center>1回目</td><td width="90px"  align=right>0.158</td></tr>
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<tr><td align=center>2回目</td><td align=right>0.147</td></tr>
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<tr><td align=center>3回目</td><td align=right>0.160</td></tr>
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<tr><td align=center>4回目</td><td align=right>0.159</td></tr>
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<tr><td align=center>5回目</td><td align=right>0.158</td></tr>
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<tr><td align=center>ave.</td><td align=right>0.156</td></tr>
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</table>
(結果)<BR>
(結果)<BR>
ゲルからの抽出は成功して吸光度計での測定で156ng/µlを記録した<BR>
ゲルからの抽出は成功して吸光度計での測定で156ng/µlを記録した<BR>
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GFP、ベクターのライゲーションとベクターのプレカルチャー<BR>
GFP、ベクターのライゲーションとベクターのプレカルチャー<BR>
(方法)<BR>
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それぞれの濃度は19 ng/µlと25 ng/µlだった。<BR>
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下記の組成に従って反応液を調整した<BR>
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<table border=1 width="200px">
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<tr><td width="130px" align=center>insert</td><td width="70px" align=right>0.5 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>vector</td><td align=right>0.5 µl</td></tr>
 +
<tr><td align=center>10 x Buffer</td><td align=right>2.5 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>F4 ligase</td><td align=right>0.5 µl</td></tr>
 +
<tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>1.0 µl</td></tr>
 +
<tr><td>&nbsp;</td><td align=right>total 5 µl</td></tr>
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Revision as of 15:07, 3 October 2011

9/14
(目的)
GFPのゲル抽出
(方法)

<a herf="http://www.qiagen.com/products/dnacleanup/gelpcrsicleanupsystems/qiaquickgelextractionkit.aspx">QIAquick Gel Extraction Kit</a>を使用してゲルからGFPのDNAを抽出した。

その後吸光度計を使って濃度の測定をした。

<tr><td>
1回目0.158
2回目0.147
3回目0.160
4回目0.159
5回目0.158
ave.0.156

(結果)
ゲルからの抽出は成功して吸光度計での測定で156ng/µlを記録した
翌日から再度ライゲーションの実験に入ることにした
9/15
(目的)
GFP、ベクターのライゲーションとベクターのプレカルチャー
(方法)
それぞれの濃度は19 ng/µlと25 ng/µlだった。



下記の組成に従って反応液を調整した

insert0.5 µl
vector0.5 µl
10 x Buffer2.5 µl
F4 ligase0.5 µl
ddH2O1.0 µl
 total 5 µl



(結果)
ライゲーションに関しては翌日のコロニーの育成は見られなかった
プレカルチャーした大腸菌は数本赤色残り白色といった色の違いが出来ていたが無事に増えて濁っていた

9/16
(目的)
GFPとベクターのライゲーション、育成した大腸菌のアルカリミニプレップ、プレカルチャー
(方法)


(結果)
GFPのコロニーの育成はほとんど見られなかった
大腸菌は途中でDNAが消えてしまい精製することが不可能になった

9/17
(目的)
GFPとベクターのライゲーション、アルカリミニプレップ、プレカルチャー
(方法)


(結果)
今度はおかしな量のコロニーの育成が見られた、もしかしたらコンタミの可能性があると考えられる（抗生物質が効いていない）、ベクターはまた精製することが出来なかった。

9/18
(目的)
プレートチェックをすることにした、ベクターの精製をまたすることにした
(方法)


(結果)
プレート自体がおかしくなっているのではないかという推測は間違ってはおらず
プレートに生えるはずのないコロニーが出てきているのもあった。
また新しくプレートを明日から作り、抗生物質も新しいものに変えることにした

9/19
(目的)
ベクターの濃度をもう一度計ってみるために濃度チェックをした
ライゲーションの失敗がコンタミしたプレートによるものであると考えて、 新しいプレートでもう一度GFPとベクターを精製しなおすことにした
一応おかしな量ではあるがプレカルチャーをしてみることにした
(方法)


(結果)
GFPの増え方は良好で大きなコロニーの育成が見られた
大腸菌ベクターの方もGFP程ではなかったがある程度の数が生えていたのでよかった
一応白く濁りはしていたので大腸菌の増えていることは確認することが出来た
9/20
(目的)
アルカリミニプレップ、制限酵素処理、MLFの濃度をチェック、ベクターのプレカルチャー
(方法)


(結果)
やはりコンタミしていると思われたコロニーからは何もバンドが形成されずライゲーションは失敗していたことが分かった
MLFのほうは濃度チェックをしてみたところおよそ70ng/µlくらいではないかということが分かりました
9/21
(目的)
プレート作成（濃度を分けて）、昨日の大腸菌のアルカリミニプレップ、プレートチェック
(方法)


(結果)
今度はプレートをクローラムフェ二コールで1000倍希釈500倍希釈250倍希釈していき濃度の違うプレートを作成することが出来た
そして翌日コンピテントセルの育成は見られずプレートの問題はなくなった
大腸菌のDNAの沈殿は見られなかった
9/22
(目的)
ベクターのアルカリミニプレップ、ベクターとGFPのライゲーション
(方法)


(結果)

9/23
(目的)
ベクターのアルカリミニプレップ、プレートチェック(提出用ベクター)
(方法)


(結果)

9/24
(目的) ベクターのアルカリミニプレップ、


(方法)


(結果) 9/25 (目的)


9/26 (目的)


9/27 (目的)

9/28 (目的)

9/29 (目的)

9/30 (目的)

10/2 (目的)

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