Team:KIT-Kyoto/yokoigawa
From 2011.igem.org
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Line 249: | Line 249: | ||
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した<br> | ↓15000rpm、4°Cで5min遠心した<br> | ||
↓上澄みを捨て、乾燥させた<br> | ↓上澄みを捨て、乾燥させた<br> | ||
- | ↓ddH<sub>2</sub>Oを44 | + | ↓ddH<sub>2</sub>Oを44 µl加えてvoltexした<br> |
Line 256: | Line 256: | ||
制限酵素処理(<i>Xho</i> I)<br> | 制限酵素処理(<i>Xho</i> I)<br> | ||
- | + | 下記の組成に従って反応液を調整した<br> | |
<table border="0"><tr><td> | <table border="0"><tr><td> | ||
Line 283: | Line 283: | ||
- | + | 37°Cで20時間静置した | |
<br></p> | <br></p> | ||
Line 296: | Line 296: | ||
【実験操作】<br> | 【実験操作】<br> | ||
PCR産物の精製(フェノールクロロホルム処理・エタノール沈殿)<br> | PCR産物の精製(フェノールクロロホルム処理・エタノール沈殿)<br> | ||
- | </strong>↓PCR産物を400 | + | </strong>↓PCR産物を400 μlまでddH<sub>2</sub>Oで薄めた<br> |
- | ↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 | + | ↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 μl加えてvoltexした<br> |
- | + | ↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した<br> | |
- | + | ↓水層のみを新しいチューブに移した<br> | |
- | ↓choloroform(CIAA) | + | ↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした<br> |
- | + | ↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した<br> | |
- | + | ↓水層のみを新しいチューブに移した<br> | |
- | ↓3M CH<sub>3</sub>COONa(pH 5.27)を1/10量、100% | + | ↓3M CH<sub>3</sub>COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した<br> |
- | + | ↓15000rpm、4°Cで10min遠心した<br> | |
- | ↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 | + | ↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 μl加えた<br> |
- | + | ↓15000rpm、4°Cで5min遠心した<br> | |
- | + | ↓上澄みを捨て、乾燥させた<br> | |
- | ↓ddH<sub>2</sub>Oを44 µ | + | ↓ddH<sub>2</sub>Oを44 µl加えてvoltexした<br> |
- | + | <br> | |
<br> | <br> | ||
Line 316: | Line 316: | ||
制限酵素処理(Xba I)<br> | 制限酵素処理(Xba I)<br> | ||
- | + | 下記の組成に従って反応液を調整した<br> | |
<table border="0"><tr><td> | <table border="0"><tr><td> | ||
Line 329: | Line 329: | ||
</table></td></tr></table> | </table></td></tr></table> | ||
- | + | 37°Cで20時間静置した | |
<br> | <br> | ||
Line 353: | Line 353: | ||
- | ↓50 | + | ↓50 Vで60分間電気泳動した<br> |
- | + | ↓EtBrでゲルを10分間染色した<br> | |
- | + | ↓UVを照射してDNAのバンドを可視化した<br> | |
<BR> | <BR> | ||
Line 373: | Line 373: | ||
制限酵素処理(Xba I)<br> | 制限酵素処理(Xba I)<br> | ||
- | + | 下記の組成に従って反応液を調整した<br> | |
<table border="0"><tr><td> | <table border="0"><tr><td> | ||
Line 384: | Line 384: | ||
<tr><td align="center"><i>Xba</i>Ⅰ</td><td align="right">1 μl</td></tr> | <tr><td align="center"><i>Xba</i>Ⅰ</td><td align="right">1 μl</td></tr> | ||
<tr><td> </td><td align="right">total 50 μl</td></tr> | <tr><td> </td><td align="right">total 50 μl</td></tr> | ||
- | </table></td></tr></table> | + | </table></td></tr></table>37°Cで20時間静置した |
<br> | <br> | ||
<BR> | <BR> | ||
Line 402: | Line 402: | ||
- | + | ↓LB培地用の試薬を計り、ビーカーに入れた<br> | |
- | ↓950 | + | ↓950 mlの蒸留水を入れ、スターラーで混ぜて溶かした<br> |
- | + | ↓三角フラスコに分注し、アルミ箔で二重にフタをした<br> | |
- | + | ↓121°Cで20分オートクレーブ滅菌した<br> | |
Line 417: | Line 417: | ||
ゲルからのDNA抽出<br> | ゲルからのDNA抽出<br> | ||
<BR> | <BR> | ||
- | <a herf="http://www.qiagen.com/products/dnacleanup/gelpcrsicleanupsystems/qiaquickgelextractionkit.aspx">QIAquick Gel Extraction Kit</a> | + | <a herf="http://www.qiagen.com/products/dnacleanup/gelpcrsicleanupsystems/qiaquickgelextractionkit.aspx">QIAquick Gel Extraction Kit</a>を使用した<br> |
- | ↓1 x | + | ↓1 x TAEに溶かしたアガロースゲルをつくった<br> |
- | ↓DNAとLording | + | ↓DNAとLording Dyeをまぜたものとマーカーをゲルにのせた<br> |
<tr><td><table border="1" width="230"> | <tr><td><table border="1" width="230"> | ||
Line 429: | Line 429: | ||
- | ↓50 | + | ↓50 Vで60分間電気泳動した<br> |
- | + | ↓EtBrでゲルを10分間染色した<br> | |
- | + | ↓UVを照射してDNAのバンドを可視化した<br></p> | |
<BR> | <BR> | ||
Line 485: | Line 485: | ||
- | ↓50 | + | ↓50 Vで60分間電気泳動した<br> |
- | + | ↓EtBrでゲルを40分間染色した<br> | |
- | + | ↓UVを照射してDNAのバンドを可視化した<br> | |
- | + | ↓清潔で鋭利な手術用メスでゲルからDNA断片を切りだした<br> | |
- | ↓1.5 | + | ↓1.5 mlチューブ中のゲルスライスの重さを量った<br> |
- | ↓ゲル100 mgに対して、3倍量(300 μl)のBuffer | + | ↓ゲル100 mgに対して、3倍量(300 μl)のBuffer QGを加えた<br> |
- | ↓42- | + | ↓42-50°Cで10分間放置し、ゲルを完全に溶かした<br> |
- | + | ↓ゲルが完全に溶けたら、溶液が黄色であることを確認すした<br> | |
- | ↓ゲル100 mgに対して、当量(100 μl)の2- | + | ↓ゲル100 mgに対して、当量(100 μl)の2-プロパノールを加え、混ぜた<br> |
- | + | ↓カラムにサンプルをのせた<br> | |
- | ↓10,000 | + | ↓10,000 rpmで1分間遠心し、抽出物を捨てた<br> |
- | ↓500 μlのBuffer | + | ↓500 μlのBuffer QGをカラムに加え、残りのゲルを溶かした<br> |
- | ↓10,000 | + | ↓10,000 rpmで1分間遠心し、ろ液を捨てた<br> |
- | ↓750 μlのwash Buffer | + | ↓750 μlのwash Buffer PEをカラムに加えた<br> |
- | ↓10,000 | + | ↓10,000 rpmで1分間遠心し、ろ液を捨てた<br> |
- | ↓カラムを新しい1.5 | + | ↓カラムを新しい1.5 mlチューブに移しかえた<br> |
- | ↓10,000 | + | ↓10,000 rpmで1分間遠心した<br> |
- | ↓カラムを新しい1.5 | + | ↓カラムを新しい1.5 mlチューブに移しかえた<br> |
- | ↓37 | + | ↓37 μlのMilliQを加えた<br> |
- | ↓10,000 | + | ↓10,000 rpmで1分間遠心した<br> |
- | ↓そのうち5 | + | ↓そのうち5 μlを20倍希釈し、濃度測定をした<br> |
<BR> | <BR> | ||
【結果】<br> | 【結果】<br> | ||
Line 516: | Line 516: | ||
トランスフォーメーション<br> | トランスフォーメーション<br> | ||
↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した<br> | ↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した<br> | ||
- | ↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 | + | ↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 μlのコンピテント細胞を分注した<br> |
- | ↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した<br>↓DNAをチューブに3 | + | ↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した<br>↓DNAをチューブに3 μl加えて、氷上で30分間冷やした<br> |
↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた<br> | ↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた<br> | ||
↓90 µlのSOC培地を加えた<br> | ↓90 µlのSOC培地を加えた<br> | ||
Line 538: | Line 538: | ||
<br> | <br> | ||
- | + | ↓LB培地を作製した<br> | |
- | ↓1 Lあたり15 gのbacto- | + | ↓1 Lあたり15 gのbacto-agarを入れて、オートクレーブ滅菌した<br> |
- | + | ↓オートクレーブから取り出し、冷めないうちにスターラーで均一になるまで撹拌した<br> | |
- | + | ↓65°C程度に冷めたら、必要であれば抗生物質を加えた<br> | |
- | ↓10 cmのディスポプラスチックシャーレ1枚につき、20~25 | + | ↓10 cmのディスポプラスチックシャーレ1枚につき、20~25 ml分注した<br> |
- | + | ↓水平な所に置いて固まらせた<br> | |
<br> | <br> | ||
Line 560: | Line 560: | ||
トランスフォーメーション<br> | トランスフォーメーション<br> | ||
↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した<br> | ↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した<br> | ||
- | ↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 | + | ↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 μlのコンピテント細胞を分注した<br> |
↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した<br> | ↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した<br> | ||
↓DNAをチューブに3 µl加えて、氷上で30分間冷やした<br> | ↓DNAをチューブに3 µl加えて、氷上で30分間冷やした<br> | ||
Line 584: | Line 584: | ||
トランスフォーメーション<br> | トランスフォーメーション<br> | ||
↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した<br> | ↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した<br> | ||
- | ↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 | + | ↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 μlのコンピテント細胞を分注した<br> |
↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した<br> | ↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した<br> | ||
- | ↓DNAをチューブに3 | + | ↓DNAをチューブに3 μl加えて、氷上で30分間冷やした<br> |
↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた<br> | ↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた<br> | ||
↓60 µlのSOC培地を加えた<br> | ↓60 µlのSOC培地を加えた<br> | ||
Line 626: | Line 626: | ||
トランスフォーメーション<br> | トランスフォーメーション<br> | ||
↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した<br> | ↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した<br> | ||
- | ↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 | + | ↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 μlのコンピテント細胞を分注した<br> |
↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した<br> | ↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した<br> | ||
- | ↓DNAをチューブに3 | + | ↓DNAをチューブに3 μl加えて、氷上で30分間冷やした<br> |
↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた<br> | ↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた<br> | ||
↓60 µlのSOC培地を加えた<br> | ↓60 µlのSOC培地を加えた<br> |
Revision as of 14:29, 27 September 2011
8/29(月)
武田、横井川
【目的】
PCR産物とpUAST-flag vectorの制限酵素処理(一回目:Xho I)
【実験操作】
PCR産物の精製(フェノールクロロホルム処理・エタノール沈殿)
↓PCR産物を400 µlまでddH2Oで薄めた
↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した
↓水層のみを新しいチューブに移した
↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した
↓水層のみを新しいチューブに移した
↓3M CH3COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した
↓15000rpm、4°Cで10min遠心した
↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した
↓上澄みを捨て、乾燥させた
↓ddH2Oを44 µl加えてvoltexした
※保存する場合 ↓-20°Cで保存した
制限酵素処理(Xho I)
下記の組成に従って反応液を調整した
|
|
8/30(火)
武田、横井川
【目的】
PCR産物とpUAST-flag vectorの制限酵素処理(二回目:Xho I)
【実験操作】
PCR産物の精製(フェノールクロロホルム処理・エタノール沈殿)
↓PCR産物を400 µlまでddH2Oで薄めた
↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した
↓水層のみを新しいチューブに移した
↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した
↓水層のみを新しいチューブに移した
↓3M CH3COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した
↓15000rpm、4°Cで10min遠心した
↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した
↓上澄みを捨て、乾燥させた
↓ddH2Oを44 µl加えてvoltexした
※保存する場合 ↓-20°Cで保存する
制限酵素処理(Xba I)
下記の組成に従って反応液を調整する
| |||||||||
vector |
PUAST-flag vector(500 ng/µl) | 10 μl |
ddH2O | 34 µl |
10 x H Buffer | 5 µl |
XhoⅠ | 1 µl |
total 50 µl |
8/31(水)
武田、横井川
【目的】
制限酵素処理したPCR産物・vectorのゲル抽出
【実験操作】
ゲルからのDNA抽出
QIAquick Gel Extraction Kitを使用する
↓1 x TAEに溶かしたアガロースゲルをつくった
↓DNAとLording Dyeをまぜたものとマーカーをゲルにのせた
1 kbpマーカー | 5 µl |
DIAP2 or PUAST-flag vector | 50 µl |
Lording Dyi | 10 µl |
↓EtBrでゲルを10分間染色した
↓UVを照射してDNAのバンドを可視化した
↓清潔で鋭利な手術用メスでゲルからDNA断片を切りだした
↓1.5 mlチューブ中のゲルスライスの重さを量った
↓ゲル100 mgに対して、3倍量(300 µl)のBuffer QGを加えた
↓42-50°Cで10分間放置し、ゲルを完全に溶かした
↓ゲルが完全に溶けたら、溶液が黄色であることを確認した
↓ゲル100 mgに対して、当量(100 µl)の2-プロパノールを加え、混ぜた
↓カラムにサンプルをのせた
↓10,000 rpmで1分間遠心し、抽出物を捨てた
↓500 µlのBuffer QGをカラムに加え、残りのゲルを溶かした
↓10,000 rpmで1分間遠心し、ろ液を捨てた
↓750 µlのwash Buffer PEをカラムに加えた
↓10,000 rpmで1分間遠心し、ろ液を捨てた
↓カラムを新しい1.5 mlチューブに移しかえた
↓10,000 rpmで1分間遠心した
↓カラムを新しい1.5 mlチューブに移しかえた
↓37 µlのMilliQを加えた
↓10,000 rpmで1分間遠心した
↓そのうち5 µlを20倍希釈し、濃度測定をした
【結果】
pUAST-flag vectorは精製でき、濃度は45.0375 ng/µlであった。
DIAP2はゲル抽出でバンドが見られなかった。
9/1(木)
武田
【目的】
DIAP2のポリメラーゼ連鎖反応
【実験操作】
下記の組成に従って試薬をまぜる
右に示したプログラムで反応を行う
|
|
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
ゲル電気泳動
ゲル1枚当たりの組成
SeaKemRGTGR-agar | 0.2 g |
1 x TAE | 20 ml |
↓上記の組成に従い、試薬を三角フラスコで混ぜてレンジで加熱し、専用容器に入れて固めた
↓制限酵素処理した反応液50 μlに対して6 x loading dye を10 μl加えた
↓サンプルとDNA maker をコーム穴に入れた
↓サンプルをセット後、50 V 60minで電気泳動した
↓電気泳動後、EtBrで10minゲルを染色した
↓染色後、MilliQでゲルを数回洗ってプレートにのせた
↓UVを照射してDNAのバンドを可視化した
9/5(月)
横井川
【目的】
PCR産物とpUAST-flag vectorの制限酵素処理(一回目:Xho I)
【実験操作】
PCR産物の精製(フェノールクロロホルム処理・エタノール沈殿)
↓PCR産物を400 µlまでddH2Oで薄めた
↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した
↓水層のみを新しいチューブに移した
↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した
↓水層のみを新しいチューブに移した
↓3M CH3COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した
↓15000rpm、4°Cで10min遠心した
↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した
↓上澄みを捨て、乾燥させた
↓ddH2Oを44 µl加えてvoltexした
制限酵素処理(Xho I)
下記の組成に従って反応液を調整した
|
|
9/6(火)
横井川
【目的】
PCR産物とpUAST-flag vectorの制限酵素処理(二回目:Xba I)
【実験操作】
PCR産物の精製(フェノールクロロホルム処理・エタノール沈殿)
↓PCR産物を400 μlまでddH2Oで薄めた
↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 μl加えてvoltexした
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した
↓水層のみを新しいチューブに移した
↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した
↓水層のみを新しいチューブに移した
↓3M CH3COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した
↓15000rpm、4°Cで10min遠心した
↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 μl加えた
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した
↓上澄みを捨て、乾燥させた
↓ddH2Oを44 µl加えてvoltexした
制限酵素処理(Xba I)
下記の組成に従って反応液を調整した
|
9/7(水)
横井川
【目的】
制限酵素処理したPCR産物・vectorのゲル抽出
【実験操作】
ゲルからのDNA抽出
QIAquick Gel Extraction Kitを使用する
↓1 x TAEに溶かしたアガロースゲルをつくる
↓DNAとLording Dyeをまぜたものとマーカーをゲルにのせる
1 kbp or 100bp マーカー | 3 ml |
DIAP2 | 50 ml |
Lording Dyi | 10 ml |
↓EtBrでゲルを10分間染色した
↓UVを照射してDNAのバンドを可視化した
【結果】
バンドが確認できなかったためゲル抽出を行う事が出来なかった。
9/17(土)
【目的】
PCR産物の制限酵素処理(二回目:Xba I)
【実験操作】
制限酵素処理(Xba I)
下記の組成に従って反応液を調整した
|
9/18(日)
横井川
LB培地
bacto tryptone | 10 g |
bacto yeast evtract | 5 g |
NaCl | 10 g |
↓LB培地用の試薬を計り、ビーカーに入れた
↓950 mlの蒸留水を入れ、スターラーで混ぜて溶かした
↓三角フラスコに分注し、アルミ箔で二重にフタをした
↓121°Cで20分オートクレーブ滅菌した
【目的】
制限酵素処理したPCR産物のゲル抽出
【実験操作】
ゲルからのDNA抽出
QIAquick Gel Extraction Kitを使用した
↓1 x TAEに溶かしたアガロースゲルをつくった
↓DNAとLording Dyeをまぜたものとマーカーをゲルにのせた
1 kbp or 100bp マーカー | 3 ml |
DIAP2 | 50 ml |
Lording Dyi | 10 ml |
↓EtBrでゲルを10分間染色した
↓UVを照射してDNAのバンドを可視化した
【結果】
バンドが確認できなかったためゲル抽出を行う事が出来なかった。
9/20(火)
【目的】
DIAP2のPCR産物の確認
【実験操作】
ゲル電気泳動
ゲル1枚当たりの組成
SeaKemRGTGR-agar | 0.2 g |
1 x TAE | 20 ml |
↓上記の組成に従い、試薬を三角フラスコで混ぜてレンジで加熱し、専用容器に入れて固める
↓制限酵素処理した反応液50 μlに対して6 x loading dye を10 μl加える
↓サンプルとDNA maker をコーム穴に入れる
↓サンプルをセット後、50 V 60minで電気泳動する
↓電気泳動後、EtBrで10minゲルを染色する
↓染色後、MilliQでゲルを数回洗ってプレートにのせる
↓UVを照射してDNAのバンドを可視化する
【目的】
MLFバンドを切り出し、そのゲル片からDNAを抽出・精製する。
【実験方法】
ゲルからのDNA抽出
QIAquick Gel Extraction Kitを使用する
↓1 x TAEに溶かしたアガロースゲルをつくる
↓DNAとLording Dyeをまぜたものとマーカーをゲルにのせる
1 kbp or 100bp マーカー | 3 ml |
MLF | 50 ml |
Lording Dyi | 7 ml |
↓EtBrでゲルを40分間染色した
↓UVを照射してDNAのバンドを可視化した
↓清潔で鋭利な手術用メスでゲルからDNA断片を切りだした
↓1.5 mlチューブ中のゲルスライスの重さを量った
↓ゲル100 mgに対して、3倍量(300 μl)のBuffer QGを加えた
↓42-50°Cで10分間放置し、ゲルを完全に溶かした
↓ゲルが完全に溶けたら、溶液が黄色であることを確認すした
↓ゲル100 mgに対して、当量(100 μl)の2-プロパノールを加え、混ぜた
↓カラムにサンプルをのせた
↓10,000 rpmで1分間遠心し、抽出物を捨てた
↓500 μlのBuffer QGをカラムに加え、残りのゲルを溶かした
↓10,000 rpmで1分間遠心し、ろ液を捨てた
↓750 μlのwash Buffer PEをカラムに加えた
↓10,000 rpmで1分間遠心し、ろ液を捨てた
↓カラムを新しい1.5 mlチューブに移しかえた
↓10,000 rpmで1分間遠心した
↓カラムを新しい1.5 mlチューブに移しかえた
↓37 μlのMilliQを加えた
↓10,000 rpmで1分間遠心した
↓そのうち5 μlを20倍希釈し、濃度測定をした
【結果】
濃度は70 ng/µlだった。
【目的】
MLFのライゲーション産物の増殖
【実験方法】
トランスフォーメーション
↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した
↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 μlのコンピテント細胞を分注した
↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した
↓DNAをチューブに3 μl加えて、氷上で30分間冷やした
↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた
↓90 µlのSOC培地を加えた
↓37°Cで1時間、振りながら回復培養した
↓LBプレート(+chloramphenicol)にまいた。
↓37゜Cで一晩インキュベートした。
9/21(水)
LBプレート作成
LB培地 | |
bacto-agar | 15 g/l |
↓LB培地を作製した
↓1 Lあたり15 gのbacto-agarを入れて、オートクレーブ滅菌した
↓オートクレーブから取り出し、冷めないうちにスターラーで均一になるまで撹拌した
↓65°C程度に冷めたら、必要であれば抗生物質を加えた
↓10 cmのディスポプラスチックシャーレ1枚につき、20~25 ml分注した
↓水平な所に置いて固まらせた
【目的】
pSB1C3 vectorとMLFのライゲーション
【実験方法】
【目的】
MLFのライゲーション産物の増殖
【実験方法】
トランスフォーメーション
↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した
↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 μlのコンピテント細胞を分注した
↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した
↓DNAをチューブに3 µl加えて、氷上で30分間冷やした
↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた
↓60 µlのSOC培地を加えた
↓37°Cで1時間、振りながら回復培養した
↓LBプレート(+chloramphenicol)にまいた。
↓37゜Cで一晩インキュベートした。
9/22(木)
【目的】
pSB1C3 vectorとMLF、pSB1C3 vectorとGFPのライゲーション
【実験方法】
【目的】
MLFおよびGFPのライゲーション産物の増殖
【実験方法】
トランスフォーメーション
↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した
↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 μlのコンピテント細胞を分注した
↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した
↓DNAをチューブに3 μl加えて、氷上で30分間冷やした
↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた
↓60 µlのSOC培地を加えた
↓37°Cで1時間、振りながら回復培養した
↓LBプレート(+chloramphenicol)にまいた。
↓37゜Cで一晩インキュベートした。
9/23
ライゲーション
【目的】
MLFおよびGFPのライゲーション
【実験方法】
9/24
プレカルチャー
【目的】 pSB1C3の増殖
【実験方法】
9/25
濃度チェック
【目的】 電気泳動によるGFPの濃度測定
【実験方法】
ライゲーション
【目的】 pSB1C3 vectorとGFPのライゲーション
【実験方法】
トランスフォーメーション<br> 【目的】
pSB1C3 vectorとGFPのライゲーション産物のトランスフォーメーション
【実験方法】
トランスフォーメーション
↓氷上でコンピテント細胞(DH5 Alpha:大腸菌株)を解凍した
↓前もって冷やしておいた1.5 mlチューブに30 μlのコンピテント細胞を分注した
↓余ったコンピテント細胞は-80°Cの冷凍庫に戻した
↓DNAをチューブに3 μl加えて、氷上で30分間冷やした
↓42°Cで45秒間熱ショックを与えた
↓60 µlのSOC培地を加えた
↓37°Cで1時間、振りながら回復培養した
↓LBプレート(+chloramphenicol)にまいた。
↓37゜Cで一晩インキュベートした。