Team:Harvard/ZF Binding Site Finder

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//add in x NTPs between first and second finger
//add in x NTPs between first and second finger
-
var nucgap = $("#gap").value;
+
var nucgap = $("#gap").val();
for(i=0;i<nucgap;i++){
for(i=0;i<nucgap;i++){
siteExp = siteExp + "\\w";
siteExp = siteExp + "\\w";
Line 128: Line 128:
//finish building regular expression
//finish building regular expression
siteExp = siteExp + zf11 + zf12 + zf13 + "){1}";
siteExp = siteExp + zf11 + zf12 + zf13 + "){1}";
-
 
-
alert(siteExp);
 
//construct regular expression and find all instances of desired sequence in the test sequence
//construct regular expression and find all instances of desired sequence in the test sequence
Line 426: Line 424:
</form>
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<br />
<br />
-
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Revision as of 04:08, 9 July 2011

iGEM 2011 Zinc Finger Binding Site Finder

iGEM 2011 Zinc Finger Binding Site Finder

Justin Chew

Bottom Zinc Finger Array:

 Top Zinc Finger Array:

 Nucleotide Gap:

 

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