"
Team:NTNU Trondheim/Journal
From 2011.igem.org
(→Lab Journal: Started editing this page) |
(→Lab Journal) |
||
| Line 6: | Line 6: | ||
'''Thursday 23/6''' | '''Thursday 23/6''' | ||
| - | + | ||
| - | + | Lab equipment was prepared: Pipette tips, 1.5 ml tubes, toothpicks, SOC, LA with 100 µg/ml ampicillin/ 100 µg/ml spectinomycin (from 1988). Recipies are given in recipies section. | |
| + | |||
Fredag 24. juni | Fredag 24. juni | ||
Revision as of 08:38, 5 July 2011
Lab Journal
Thursday 23/6
Lab equipment was prepared: Pipette tips, 1.5 ml tubes, toothpicks, SOC, LA with 100 µg/ml ampicillin/ 100 µg/ml spectinomycin (from 1988). Recipies are given in recipies section.
Fredag 24. juni
Resuspenderte og transformerte BioBricks rrnB P1, lamda pR, RFP og Lux. Prosedyre gitt i Prosedyrer / Oppskrifter.
Lørdag 25. juni Flyttet plater til kjøleskap.
Søndag 26. juni
De fire Biobrickene (p1, lamda pR, RFP og Lux) ble inokulert i 3mL LB for isolering av plasmid.
Mandag 27. juni
Plasmid ble isolert fra P1, lamda pR, RFP og Lux Biobrickene ved bruk av promega miniprep kit.
Konsentrasjoner:
P1 98,4 ng / µL lambda Pr: 43,8 ng / µL RFP 141,8 ng / µL Lux 62,8 ng / µL
Transformantene med lux/RFP var verken røde eller lysende. Det ble foreslått at dette kunne være pga. mulig ekspresjon av tetR som er repressor for pTet som styrer ekspresjon av RFP/lux. Denne antagelsen ble bekreftet av erfaringer som er gjort av tidligere grupper med samme konstrukt.
Siden tetR sin påvirking på pTet blir inhibert av Tc(tetracyclin) prøvde vi å gro cellene i subletale konsentrasjoner av Tc.
E. coli med plasmid med RFP-konstruktet ble grodd i 0 0,1 0,3 0,6 1,0 1,5 og 100 µg/ml Tc i 3 ml LB.
Måling av fluorescens:
Hanne Jørgensen kan ordne dette, dersom vi gror kultur med RFP-uttrykk og uten (blank kontroll). Hun må også bli informert om bølgelengde for exitation (584 nm) og emission (607 nm).
mail : hanne.jorgensen@biotech.ntnu.no
Tirsdag 28 juni
Jon Har Bursdag! Jippi!! Hoi Hoi Hoi!!
Ligering av lambda pR inn i backbone:
· Kutte RFP og RFP + luxI construct med EcoRI og XbaI.
· Kutte lambda pR med EcoRI og SpeI
· Ligate them bitches – win
Kuttet RFP, Lux og Lambda Pr promotor ved bruk av iGem sin protokoll. http://partsregistry.org/Help:Protocols/Restriction_Digest
Alternativ design av system som skal gjøre cellene røde ved tilsats av ppGpp:
