Team:HUST-China/Overview

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&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Because of the growing popularity of iGEM, an increasing number of people tend to be a member of the big family of iGEM. Ideas for this competition are come up with mostly in the following two ways:
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&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;我们所设计的完整软件
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SEA是一个纯WEB化的合成生物学工程菌设计平台,无需下载软件及安装软件。同时是一个网络交互性的平台。用户可利用它:
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a.了解合成生物学
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SEA提供合成生物学已有的功能性元件、标准的实验方案,用户可以对合成生物学的成果与进展有整体的了解,不必关注过多的细节。用户可方便地查看感兴趣的功能元件:以该元件为中心,与之相关的元件将清晰地呈现在自动生成的网络图中。
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b.创造新的功能元件
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SEA提供功能元件的动态连接功能,用户还可以交互式修改与添加有意义的功能元件,用来创造性地构建工程菌。
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c.设计工程菌
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用户选定感兴趣或自定义的功能元件后可进行实际的编辑设计与组装搭配,逐步构建工程菌。
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e.基因通路生成
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SEA根据用户编辑好的工程菌生成具有实验指导意义的基因通路。
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f.实验方案设计
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SEA根据用户选择的基因通路自动生成标准化的一系列实验参考方案。
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g.导出系统生物学标记语言(SBML)
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用户可将设计好的工程菌导出到SBML文件中,然后根据SEBD提供的多种支持SBML语言的软件相关链接,选择合适的软件进行分析与建模。
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Revision as of 03:55, 6 October 2011


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Overview


      我们所设计的完整软件 SEA是一个纯WEB化的合成生物学工程菌设计平台,无需下载软件及安装软件。同时是一个网络交互性的平台。用户可利用它: a.了解合成生物学 SEA提供合成生物学已有的功能性元件、标准的实验方案,用户可以对合成生物学的成果与进展有整体的了解,不必关注过多的细节。用户可方便地查看感兴趣的功能元件:以该元件为中心,与之相关的元件将清晰地呈现在自动生成的网络图中。 b.创造新的功能元件 SEA提供功能元件的动态连接功能,用户还可以交互式修改与添加有意义的功能元件,用来创造性地构建工程菌。 c.设计工程菌 用户选定感兴趣或自定义的功能元件后可进行实际的编辑设计与组装搭配,逐步构建工程菌。 e.基因通路生成 SEA根据用户编辑好的工程菌生成具有实验指导意义的基因通路。 f.实验方案设计 SEA根据用户选择的基因通路自动生成标准化的一系列实验参考方案。 g.导出系统生物学标记语言(SBML) 用户可将设计好的工程菌导出到SBML文件中,然后根据SEBD提供的多种支持SBML语言的软件相关链接,选择合适的软件进行分析与建模。

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