Team:KIT-Kyoto/matsunami
From 2011.igem.org
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<body> | <body> | ||
- | < | + | |
- | <table | + | 8月8日(月)<br> |
- | + | <br> | |
- | + | 松浪、横井川<br> | |
- | + | <br> | |
- | + | 【目的】<br> | |
- | + | cDNA | |
- | + | vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | |
- | + | <br> | |
- | + | 【実験操作】<br> | |
- | + | <table border="0"><tr><td> | |
- | + | <table border="0" width="150px"> | |
- | + | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | |
- | + | </table> | |
- | + | <table border=1 width="220px"> | |
- | + | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | |
- | + | </table> | |
- | + | </td><TD></TD><TD></TD><td> | |
- | + | <table border="0" width="100px"> | |
- | + | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | |
- | + | </table> | |
- | + | <table border=1 width="400px"> | |
- | + | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>(Tm-5)°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | |
- | + | </table> | |
- | + | </td></tr> | |
</table> | </table> | ||
- | |||
- | |||
- | |||
- | < | + | <BR> |
- | < | + | |
- | < | + | 下記の組成に従って試薬をまぜた。<br> |
- | < | + | 右に示したプログラムで反応を行った。<br> |
- | < | + | <br> |
- | < | + | *<プライマーの塩基配列><br> |
- | < | + | ・DIAP2<br> |
+ | F primer:GCTTCTCGAGACGGAGCTGGGCATGGAGCT<br> | ||
+ | Tm値 69゜C<br> | ||
+ | R primer:GCCGTCTAGATCACGAAAGGAACGTGCGCA<br> | ||
+ | Tm値 66.4゜C<br> | ||
+ | 増幅サイズ 約1514 bp<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | ・API2-MALT1<br> | ||
+ | F primer:GCCGCTCGAGAACATAGTAGAAAACAGCAT | ||
+ | Tm値 57.8゜C<br> | ||
+ | R primer:GCCGGCTAGCTCATTTTTCAGAAATTCTGA<br> | ||
+ | Tm値 56.5゜C<br> | ||
+ | 増幅サイズ 約3131 bp<br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | 8月9日(火)<br> | ||
<br> | <br> | ||
松浪、横井川<br> | 松浪、横井川<br> | ||
<br> | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | PCR産物の確認<br> | |
+ | |||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | |||
+ | <table border="1" width="200px"> | ||
+ | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | pUAST溶液の形質転換<br> | ||
+ | |||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | |||
+ | ↓pUAST 1 µlとコンピテントセルを混合した。<br> | ||
+ | ↓これを氷上で15min放置した。<br> | ||
+ | ↓43°Cで30sec温め、氷上で10min放置した。<br> | ||
+ | ↓これをLBプレートに塗り37°Cでincubateした。<br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | 8月10日(水)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | cDNA | ||
vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | ||
<br> | <br> | ||
【実験操作】<br> | 【実験操作】<br> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>(Tm-5)°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <BR> | ||
+ | |||
+ | 下記の組成に従って試薬をまぜた。<br> | ||
+ | 右に示したプログラムで反応を行った。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | 大腸菌の培養<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | ↓ガスバーナーで加熱滅菌したつまようじでLB(amp+)プレートから生えてきた大腸菌のコロニーをついた。<br> | ||
+ | ↓ついた先端を2個のLB培地(amp+)2 mlに攪拌した。<br> | ||
+ | ↓pUASTとコンピテントセルの混合物を10 µl、100 µlをそれぞれまいた。<br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | 8月11日(木)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | pUAST flag | ||
+ | vectorの大量精製<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | ↓培養液1.5 mLを、15000 rpm、5min、4°Cの条件で遠心した。この間にglucose solution、5M K-acetate pH 4.8を氷上で冷やした。<br> | ||
+ | ↓上清を廃棄しglucose solution 100 µl加えて攪拌し、沈殿物を溶解した。<br> | ||
+ | ↓0.2N NaOH 1% SDS 200 µlを加えてよく混ぜ、氷上に5min放置した。<br> | ||
+ | ↓5M K-acetate pH 4.8 150 µlを加えてよく混ぜ、氷上に5min放置した。<br> | ||
+ | ↓15000 rpm、10min、4°Cの条件で遠心した。<br> | ||
+ | ↓上清を新しいチューブに移し、isopropanolを等量入れ攪拌し3min静置した。<br> | ||
+ | ↓15000 rpm、10min、25°Cの条件で遠心した。<br> | ||
+ | ↓上清を廃棄し70% EtOH 200 µlを加えて軽く攪拌し3min静置した。その後、15000 rpm、10min、25°Cの条件で再び遠心した。<br> | ||
+ | ↓上清を廃棄し乾燥させてRnase in TE 20 µlを加えた。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | PCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | <table border="1" width="200px"> | ||
+ | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | 8月12日(金)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪、横井川<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | pUAST flag | ||
+ | vectorの大量精製<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | ↓培養した大腸菌をオートクレーブした遠心管で4000 G、10min、25°Cの条件で遠心し、遠心後上清を捨てた。<br> | ||
+ | ↓R3 with RNase A4 を4 mL加えて、攪拌し完全に溶解させた。<br> | ||
+ | ↓L7を4 mLを加え丁寧に混合し5min室温で静置した。<br> | ||
+ | ↓N3を4 mL加えてすぐに混ぜた。これを12000 G、10min、25°Cの条件で遠心し、遠心後上清を捨てた。<br> | ||
+ | ↓事前にEQ1 10 mLを加えて平衡化していたカラムに上清をLoadし、上清が流れ落ちるのを待った。このとき、一部をチューブに保存した。<br> | ||
+ | ↓Wash Buffer (W8) 10 mLを加えて洗浄した。これを2回行った。<br> | ||
+ | ↓Elution buffer (E4)を5 mL加えてDNAを溶出させた。追加で、E4 2 mLをLoadし、別のチューブに保存した。<br> | ||
+ | ↓isopropanol 3.5 mLを加えて混合し、これを15000 G、40min、4°Cの条件で遠心し、上清を捨てた。<br> | ||
+ | ↓70% EtOH 3mLを加えて再懸濁し、15000G、5min、4℃の条件で再び遠心し、上清を捨てた。<br> | ||
+ | ↓Air-dryで乾燥させ200 µlでのTEに溶かした。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | ↓次にこの溶液のDNA濃度測定を行った。<br> | ||
+ | ↓ddH<sub>2</sub>O 100 µlおよび、精製したDNA溶液を100倍希釈した溶液を準備した。<br> | ||
+ | ↓ddH<sub>2</sub>O 100 µlでゼロ補正を行い、サンプル1、5の吸光度を測定した。結果を以下に示す(表1)。<br> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | 表1、サンプル1、5の吸光度の値<br> | ||
+ | サンプル1<br> | ||
+ | <table border=1 width="500px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=rjght>0.189</td><td width="100px" align=rjght>0.208</td><td width="100px" align=rjght>0.192</td><td width="100px" align=rjght>0.190</td><td width="100px" align=rjght>0.191</td></tr><table> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | 平均は0.194であった。<br> | ||
+ | これより、サンプル1のDNA濃度は0.970 µg/µlであった。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | サンプル5<br> | ||
+ | <table border=1 width="500px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=rjght>0.282</td><td width="100px" align=rjght>0.276</td><td width="100px" align=rjght>0.278</td><td width="100px" align=rjght>0.269</td><td width="100px" align=rjght>0.269</td></tr><table> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | 平均は0.275でった。<br> | ||
+ | これより、サンプル5のDNA濃度は1.37 µg/µlであった。<br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | PCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | <table border="1" width="200px"> | ||
+ | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | 8月15日(月)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪、横井川<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖とPCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | ・API2-MALT1<br> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>58.9°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | ・DIAP2<br> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>53°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | <BR> | ||
+ | |||
+ | 下記の組成に従って試薬をまぜた。<br> | ||
+ | 右に示したプログラムで反応を行った。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | PCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | <table border="1" width="200px"> | ||
+ | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | 8月16日(火)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖とPCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | ・API2-MALT1<br> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>53°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
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+ | ・DIAP2<br> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>58.9°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | PCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | <table border="1" width="200px"> | ||
+ | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 8月17日(水)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪、横井川<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖とPCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | ・API2-MALT1<br> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>53.5°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ・DIAP2<br> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>50.5°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | PCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | <table border="1" width="200px"> | ||
+ | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | 8/23(火)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<font color=red>←ぷろとこるのテーブルをコピペする!!</font><br> | ||
(1)PCR反応液の調製<br> | (1)PCR反応液の調製<br> | ||
| | ||
<1本分あたり><br> | <1本分あたり><br> | ||
- | + | KOD+ polymelase 1 | |
- | µL<br> | + | µL<br> |
- | 10 | + | 10 x |
- | + | Buffer | |
- | + | 2 µL <br> | |
- | & | + | dNTP(2.0 |
- | + | µM) 5 | |
- | + | µL<br> | |
- | & | + | F primer(10 |
- | + | µM) | |
- | + | 1.5 µL<br> | |
- | µL<br> | + | R primer(10 |
- | R primer& | + | µM) |
- | + | 1.5 | |
- | µL <br> | + | µL <br> |
+ | | ||
Templet | Templet | ||
DNA | DNA | ||
- | 1 | + | 1 µL<br> |
- | µL<br> | + | |
- | milliQ | + | milliQ 33 |
µL<br> | µL<br> | ||
<br> | <br> | ||
Line 90: | Line 552: | ||
上記の分量を混合した。<br> | 上記の分量を混合した。<br> | ||
<br> | <br> | ||
- | + | | |
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
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- | + | ||
- | + | ||
<br> | <br> | ||
<br> | <br> | ||
- | + | (2)PCR反応条件<br> | |
- | (2)PCR反応条件<br> | + | <1>×1 Pre-denature 94 |
- | <1>×1 Pre-denature | + | ℃ 2 min<br> |
- | + | ||
- | min | + | |
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
<br> | <br> | ||
+ | | ||
+ | <2>×35 Denature 94 ℃ | ||
+ | 15 | ||
+ | sec<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | ・DIAP2<br> | ||
| | ||
- | + | Annealing 50.5 ℃ 30 | |
- | + | ||
- | + | ||
- | ℃ 30 | + | |
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
sec<br> | sec<br> | ||
| | ||
- | + | Extension 68 | |
- | + | ℃ 1 min 40 | |
- | ℃ | + | sec<br> |
+ | ・API2-MALT1<br> | ||
+ | |||
+ | Annealing ℃ | ||
30 | 30 | ||
- | |||
- | |||
- | |||
- | |||
- | |||
- | |||
sec<br> | sec<br> | ||
+ | | ||
+ | Extension 68 | ||
+ | ℃ 3 | ||
+ | min<br> | ||
<br> | <br> | ||
- | <br> | + | <br> |
+ | <3> | ||
+ | 72℃ 10 min<br> | ||
+ | | ||
+ | <4> 4℃ | ||
+ | ∞<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | | ||
上記の条件でPCRを行った。<br> | 上記の条件でPCRを行った。<br> | ||
<br> | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | PCR産物の確認<br> | ||
<br> | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | <table border="1" width="200px"> | ||
+ | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
<br> | <br> | ||
- | |||
<br> | <br> | ||
- | + | <br> | |
+ | 8月24日(水)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪<br> | ||
<br> | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | |
<br> | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | ・API2-MALT1<br> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>51.5°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
- | + | 鋳型DNAを10、100倍希釈後、上記の条件でPCRを行った。<br> | |
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | <br> | + | |
<br> | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | PCR産物の確認<br> | |
<br> | <br> | ||
【実験操作】<br> | 【実験操作】<br> | ||
- | + | <table border="1" width="200px"> | |
- | + | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | |
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
<br> | <br> | ||
<br> | <br> | ||
- | + | 8月25日(木)<br> | |
- | + | ||
<br> | <br> | ||
松浪<br> | 松浪<br> | ||
<br> | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | |
- | vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | + | |
<br> | <br> | ||
- | 【実験操作】<br> | + | 【実験操作】<font color=red>←ぷろとこるのテーブルをコピペする!!</font><br> |
- | + | ・API2-MALT1<br> | |
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>51.5°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
<br> | <br> | ||
+ | | ||
+ | ・DIAP2<br> | ||
+ | (1)PCR反応液の調製()<br> | ||
+ | | ||
+ | <1本分あたり><br> | ||
+ | KOD+ polymelase 1 | ||
+ | µL<br> | ||
+ | 10 x | ||
+ | Buffer | ||
+ | 2 µL <br> | ||
+ | dNTP(2.0 | ||
+ | µM) 5 | ||
+ | µL<br> | ||
+ | F primer(10 | ||
+ | µM) | ||
+ | 1.5 µL<br> | ||
+ | R primer(10 | ||
+ | µM) | ||
+ | 1.5 | ||
+ | µL <br> | ||
+ | | ||
+ | Templet | ||
+ | DNA | ||
+ | 1 µL<br> | ||
+ | | ||
+ | milliQ 33 | ||
+ | µL<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | | ||
+ | 上記の分量を混合した。<br> | ||
+ | | ||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | (2)PCR反応条件<br> | ||
+ | <1>×1 Pre-denature 94 | ||
+ | ℃ 2 min<br> | ||
<br> | <br> | ||
- | + | | |
- | + | <2>×35 Denature 94 ℃ | |
+ | 15 | ||
+ | sec<br> | ||
+ | | ||
+ | Annealing 50.5 ℃ 30 | ||
+ | sec<br> | ||
+ | | ||
+ | Extension 68 | ||
+ | ℃ 1 min 40 | ||
+ | sec<br> | ||
<br> | <br> | ||
- | + | <3> | |
- | + | 4℃ | |
- | + | ∞<br> | |
- | + | <br> | |
- | & | + | |
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+ | | ||
+ | 上記の条件でPCRを行った。<br> | ||
<br> | <br> | ||
- | |||
- | |||
- | |||
<br> | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | PCR産物の確認<br> | |
- | + | ||
<br> | <br> | ||
【実験操作】<br> | 【実験操作】<br> | ||
- | + | <table border="1" width="200px"> | |
- | + | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | |
- | + | </table> | |
- | + | ||
- | + | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | |
- | + | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | |
- | + | ||
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- | + | ||
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+ | 9月12日(月) | ||
<br> | <br> | ||
松浪、横井川<br> | 松浪、横井川<br> | ||
<br> | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | |
- | + | ||
- | + | ||
<br> | <br> | ||
- | 【実験操作】<br> | + | 【実験操作】<font color=red>←ぷろとこるのテーブルをコピペする!!</font><br> |
- | + | (1)PCR反応液の調製<br> | |
- | + | | |
- | + | <1本分あたり><br> | |
- | + | KOD+ polymelase | |
- | + | 1 | |
- | + | µL<br> 10 x | |
- | + | Buffer | |
- | + | 2 µL <br> | |
- | + | | |
- | + | dNTP(2.0 | |
- | + | µM) 5 µL<br> F | |
- | + | primer(10 | |
- | + | µM) | |
- | + | 1.5 µL<br> | |
- | + | R primer(10 | |
- | + | µM) | |
- | + | 1.5 | |
- | + | µL <br> | |
- | & | + | |
+ | Templet | ||
+ | DNA | ||
+ | 1 µL<br> | ||
+ | milliQ 33 | ||
+ | µL<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | | ||
+ | 上記の分量を混合した。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | *<プライマーの塩基配列><br> | ||
+ | ・DIAP2<br> | ||
+ | | ||
+ | F | ||
+ | primer : | ||
+ | Tm値<br> | ||
+ | | ||
+ | GCTTCTCGATTGACGGAGCTGGGCATGGAGCT 62 ℃<br> | ||
+ | R primer | ||
+ | :<br> | ||
+ | | ||
+ | GCCGTCTAGATCACGAAAGGAACGTGCGCA | ||
+ | 66.4 ℃<br> | ||
+ | 増幅サイズ 約1514 | ||
+ | bp<br> | ||
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- | + | | |
- | + | <br> | |
- | & | + | <br> |
- | + | (2)PCR反応条件<br> | |
- | & | + | <1>×1 Pre-denature 94 |
- | + | ℃ 2 min<br> | |
- | <br> | + | |
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
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- | + | | |
- | + | <2>×35 Denature 94 ℃ | |
- | + | 15 | |
- | + | sec<br> | |
- | + | | |
- | + | Annealing 50.5 ℃ 30 | |
- | + | sec<br> | |
- | + | | |
- | + | Extension 68 | |
- | + | ℃ 1 min 40 | |
- | + | sec<br> | |
- | + | ||
- | & | + | |
<br> | <br> | ||
- | + | <3> | |
- | + | 4℃ | |
+ | ∞<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 上記の条件でPCRを行った。<br> | ||
<br> | <br> | ||
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- | + | <br> | |
+ | 9月13日(火)<br> | ||
<br> | <br> | ||
松浪、横井川<br> | 松浪、横井川<br> | ||
<br> | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | PCR産物の確認<br> | |
- | + | ||
<br> | <br> | ||
【実験操作】<br> | 【実験操作】<br> | ||
- | + | <table border="1" width="200px"> | |
- | + | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | |
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
<br> | <br> | ||
- | |||
<br> | <br> | ||
<br> | <br> | ||
- | + | 9月14日(水)<br> | |
<br> | <br> | ||
- | + | 松浪、横井川<br> | |
<br> | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | |
- | + | ||
<br> | <br> | ||
【実験操作】<br> | 【実験操作】<br> | ||
- | + | <table border="0"><tr><td> | |
- | + | <table border="0" width="150px"> | |
- | + | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | |
- | + | </table> | |
- | + | <table border=1 width="220px"> | |
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>0.4 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x Ex Taq Buffer</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Takara Ex Taq</td><td align=right>0.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>2.0 mM dNTPs</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>14.1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 20 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>30sec</td><td align=center rowspan=3>37 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>51.5°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>1kb/min</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>+Extension</td><td align=center>72°C</td><td align=center>10min</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
<br> | <br> | ||
- | + | *プライマーの塩基配列<br> | |
+ | ・API2-MALT1<br> | ||
+ | F primer<br> | ||
+ | GCCGCTCGAGAACATAGTAGAAAACAGCAT<br> | ||
+ | Tm値<br> | ||
+ | 57.8 ゜C<br> | ||
+ | R primer<br> | ||
+ | GCCGGCTAGCTCATTTTTCAGAAATTCTGA<br> | ||
+ | Tm値<br> | ||
+ | 56.5 ゜C<br> | ||
+ | 増幅サイズ 約3131 bp<br> | ||
<br> | <br> | ||
<br> | <br> | ||
- | + | 【目的】<br> | |
+ | PCR産物の確認<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br> | ||
+ | <table border="1" width="200px"> | ||
+ | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 9月15日(木)<br> | ||
<br> | <br> | ||
松浪、横井川<br> | 松浪、横井川<br> | ||
<br> | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖<br> | ||
<br> | <br> | ||
+ | 【実験方法】<br> | ||
+ | 以下の条件でPCRを行った。<BR> | ||
+ | <table border="0"><tr><td> | ||
+ | <table border="0" width="150px"> | ||
+ | <tr><td align=center>PCR条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="220px"> | ||
+ | <tr><td width="150px" align=center>10 µM Primer F</td><td width="70px" align=right>1.5 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 µM Primer R</td><td align=right>1.5 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Template DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x PCR Buffer for KOD Plus</td><td align=right>5 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>dNTPs</td><td align=right>5 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>MgSO<sub>4</sub></td><td align=right>2 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>33 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>KOD Plus</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 50 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td><TD></TD><TD></TD><td> | ||
+ | <table border="0" width="100px"> | ||
+ | <tr><td align=center>Cycle条件</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="400px"> | ||
+ | <tr><td width="100px" align=center>Pre-Denature</td><td width="100px" align=center>94°C</td><td width="100px" align=center>2min</td></td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Denature</td><td align=center>94°C</td><td align=center>15sec</td><td align=center rowspan=3>35 Cycle</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Anneling</td><td align=center>50.5°C</td><td align=center>30sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>Extension</td><td align=center>68°C</td><td align=center>1min 40sec</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>End</td><td align=center>4°C</td><td align=center>keep</td><td width="100px"> </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <br> | ||
+ | 各サンプルを回収し、-20゜Cで保存した。 | ||
+ | <br> | ||
+ | *<プライマーの塩基配列><br> | ||
+ | ・DIAP2<br> | ||
+ | | ||
+ | F | ||
+ | primer : | ||
+ | Tm値<br> | ||
+ | | ||
+ | GCTTCTCGATTGACGGAGCTGGGCATGGAGCT 62 ℃<br> | ||
+ | R primer | ||
+ | :<br> | ||
+ | | ||
+ | GCCGTCTAGATCACGAAAGGAACGTGCGCA | ||
+ | 66.4 ℃<br> | ||
+ | 増幅サイズ 約1514 | ||
+ | bp<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | | ||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
+ | <br> | ||
【目的】<br> | 【目的】<br> | ||
- | + | PCR産物の確認<br> | |
- | + | ||
<br> | <br> | ||
【実験操作】<br> | 【実験操作】<br> | ||
- | + | <table border="1" width="200px"> | |
- | + | <tr><td width="140px" align=center>PCR反応液</td><td width="60px" align=right>2 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>8 µl</td></tr> | |
- | + | <tr><td align=center>6 x loading dye</td><td align=right>2 µl</td></tr> | |
- | + | </table> | |
+ | |||
+ | 上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。<br> | ||
+ | EtBr染色を行い、写真を撮った。<br> | ||
<br> | <br> | ||
- | |||
<br> | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | PCR産物の制限酵素処理<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br>↓PCR産物を400 µlまでddH<sub>2</sub>Oで薄めた。<BR> | ||
+ | ↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした。<BR> | ||
+ | ↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。<BR> | ||
+ | ↓水層のみを新しいチューブに移した。<BR> | ||
+ | ↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした。<BR> | ||
+ | ↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。<BR> | ||
+ | ↓水層のみを新しいチューブに移した。<BR> | ||
+ | ↓3M CH<sub>3</sub>COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した。<BR> | ||
+ | ↓15000rpm、4°Cで10min遠心した。<BR> | ||
+ | ↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた。<BR> | ||
+ | ↓15000rpm、4°Cで5min遠心した。<BR> | ||
+ | ↓上澄みを捨て、乾燥させた。<BR> | ||
+ | ↓ddH<sub>2</sub>Oを44 µl加えてvoltexした。<BR> | ||
+ | <br> | ||
+ | 下記の組成に従って反応液を調整した。<BR> | ||
+ | |||
+ | <TABLE border="0"><TR><TD> | ||
+ | <table border="0"> | ||
+ | <tr><td>cDNA</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="200px"> | ||
+ | <tr><td width"150px" align=center>PCR産物 in ddH<sub>2</sub>O</td><td width"50px" align=right>44 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x H Buffer</td><td align=right>5 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center><I>Xho</I>Ⅰ</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 50 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </TD><TD></TD><TD></TD><TD> | ||
+ | <table border="0"> | ||
+ | <tr><td>vector</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table border=1 width="250px"> | ||
+ | <tr><td width"200px" align=center>PUAST-flag vector(500 ng/µl)</td><td width"50px" align=right>10 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>34 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center>10 x H Buffer</td><td align=right>5 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td align=center><I>Xho</I>Ⅰ</td><td align=right>1 µl</td></tr> | ||
+ | <tr><td> </td><td align=right>total 50 µl</td></tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | </TD></TR> | ||
+ | </TABLE> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | 37°Cで20時間静置した。 | ||
+ | |||
+ | <BR> | ||
+ | |||
+ | 9月16日(金)<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 松浪、横井川<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【目的】<br> | ||
+ | PCR産物の制限酵素処理<br> | ||
+ | <br> | ||
+ | 【実験操作】<br>↓PCR産物を400 µlまでddH<sub>2</sub>Oで薄めた。<BR> | ||
+ | ↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした。<BR> | ||
+ | ↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。<BR> | ||
+ | ↓水層のみを新しいチューブに移した。<BR> | ||
+ | ↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした。<BR> | ||
+ | ↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。<BR> | ||
+ | ↓水層のみを新しいチューブに移した。<BR> | ||
+ | ↓3M CH<sub>3</sub>COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した。<BR> | ||
+ | ↓15000rpm、4°Cで10min遠心した。<BR> | ||
+ | ↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた。<BR> | ||
+ | ↓15000rpm、4°Cで5min遠心した。<BR> | ||
+ | ↓上澄みを捨て、乾燥させた。<BR> | ||
+ | ↓ddH<sub>2</sub>Oを44 µl加えてvoltexした。<BR> | ||
+ | <br> | ||
+ | 下記の組成に従って反応液を調整した。<BR> | ||
+ | <br> | ||
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Latest revision as of 04:27, 30 September 2011
8月8日(月)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】
|
|
下記の組成に従って試薬をまぜた。
右に示したプログラムで反応を行った。
*<プライマーの塩基配列>
・DIAP2
F primer:GCTTCTCGAGACGGAGCTGGGCATGGAGCT
Tm値 69゜C
R primer:GCCGTCTAGATCACGAAAGGAACGTGCGCA
Tm値 66.4゜C
増幅サイズ 約1514 bp
・API2-MALT1
F primer:GCCGCTCGAGAACATAGTAGAAAACAGCAT Tm値 57.8゜C
R primer:GCCGGCTAGCTCATTTTTCAGAAATTCTGA
Tm値 56.5゜C
増幅サイズ 約3131 bp
8月9日(火)
松浪、横井川
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
上記の溶液を混合し、この溶液を1%アガロースゲルで100 V、30minの条件で電気泳動した。
EtBr染色を行い、写真を撮った。
【目的】
pUAST溶液の形質転換
【実験操作】
↓pUAST 1 µlとコンピテントセルを混合した。
↓これを氷上で15min放置した。
↓43°Cで30sec温め、氷上で10min放置した。
↓これをLBプレートに塗り37°Cでincubateした。
8月10日(水)
松浪
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】
|
|
下記の組成に従って試薬をまぜた。
右に示したプログラムで反応を行った。
【目的】
大腸菌の培養
【実験操作】
↓ガスバーナーで加熱滅菌したつまようじでLB(amp+)プレートから生えてきた大腸菌のコロニーをついた。
↓ついた先端を2個のLB培地(amp+)2 mlに攪拌した。
↓pUASTとコンピテントセルの混合物を10 µl、100 µlをそれぞれまいた。
8月11日(木)
松浪
【目的】
pUAST flag vectorの大量精製
【実験操作】
↓培養液1.5 mLを、15000 rpm、5min、4°Cの条件で遠心した。この間にglucose solution、5M K-acetate pH 4.8を氷上で冷やした。
↓上清を廃棄しglucose solution 100 µl加えて攪拌し、沈殿物を溶解した。
↓0.2N NaOH 1% SDS 200 µlを加えてよく混ぜ、氷上に5min放置した。
↓5M K-acetate pH 4.8 150 µlを加えてよく混ぜ、氷上に5min放置した。
↓15000 rpm、10min、4°Cの条件で遠心した。
↓上清を新しいチューブに移し、isopropanolを等量入れ攪拌し3min静置した。
↓15000 rpm、10min、25°Cの条件で遠心した。
↓上清を廃棄し70% EtOH 200 µlを加えて軽く攪拌し3min静置した。その後、15000 rpm、10min、25°Cの条件で再び遠心した。
↓上清を廃棄し乾燥させてRnase in TE 20 µlを加えた。
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
8月12日(金)
松浪、横井川
【目的】
pUAST flag vectorの大量精製
【実験操作】
↓培養した大腸菌をオートクレーブした遠心管で4000 G、10min、25°Cの条件で遠心し、遠心後上清を捨てた。
↓R3 with RNase A4 を4 mL加えて、攪拌し完全に溶解させた。
↓L7を4 mLを加え丁寧に混合し5min室温で静置した。
↓N3を4 mL加えてすぐに混ぜた。これを12000 G、10min、25°Cの条件で遠心し、遠心後上清を捨てた。
↓事前にEQ1 10 mLを加えて平衡化していたカラムに上清をLoadし、上清が流れ落ちるのを待った。このとき、一部をチューブに保存した。
↓Wash Buffer (W8) 10 mLを加えて洗浄した。これを2回行った。
↓Elution buffer (E4)を5 mL加えてDNAを溶出させた。追加で、E4 2 mLをLoadし、別のチューブに保存した。
↓isopropanol 3.5 mLを加えて混合し、これを15000 G、40min、4°Cの条件で遠心し、上清を捨てた。
↓70% EtOH 3mLを加えて再懸濁し、15000G、5min、4℃の条件で再び遠心し、上清を捨てた。
↓Air-dryで乾燥させ200 µlでのTEに溶かした。
↓次にこの溶液のDNA濃度測定を行った。
↓ddH2O 100 µlおよび、精製したDNA溶液を100倍希釈した溶液を準備した。
↓ddH2O 100 µlでゼロ補正を行い、サンプル1、5の吸光度を測定した。結果を以下に示す(表1)。
表1、サンプル1、5の吸光度の値
サンプル1
0.189 | 0.208 | 0.192 | 0.190 | 0.191 |
0.282 | 0.276 | 0.278 | 0.269 | 0.269 |
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
8月15日(月)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖とPCR産物の確認
【実験操作】
・API2-MALT1
|
|
・DIAP2
|
|
下記の組成に従って試薬をまぜた。
右に示したプログラムで反応を行った。
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
8月16日(火)
松浪
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖とPCR産物の確認
【実験操作】
・API2-MALT1
|
|
|
|
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
8月17日(水)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖とPCR産物の確認
【実験操作】
・API2-MALT1
|
|
|
|
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
8/23(火)
松浪
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】←ぷろとこるのテーブルをコピペする!!
(1)PCR反応液の調製
<1本分あたり>
KOD+ polymelase 1 µL
10 x Buffer 2 µL
dNTP(2.0 µM) 5 µL
F primer(10 µM) 1.5 µL
R primer(10 µM) 1.5 µL
Templet DNA 1 µL
milliQ 33 µL
上記の分量を混合した。
(2)PCR反応条件
<1>×1 Pre-denature 94 ℃ 2 min
<2>×35 Denature 94 ℃ 15 sec
・DIAP2
Annealing 50.5 ℃ 30 sec
Extension 68 ℃ 1 min 40 sec
・API2-MALT1
Annealing ℃ 30 sec
Extension 68 ℃ 3 min
<3> 72℃ 10 min
<4> 4℃ ∞
上記の条件でPCRを行った。
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
8月24日(水)
松浪
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】
・API2-MALT1
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【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
8月25日(木)
松浪
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】←ぷろとこるのテーブルをコピペする!!
・API2-MALT1
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・DIAP2
(1)PCR反応液の調製()
<1本分あたり>
KOD+ polymelase 1 µL
10 x Buffer 2 µL
dNTP(2.0 µM) 5 µL
F primer(10 µM) 1.5 µL
R primer(10 µM) 1.5 µL
Templet DNA 1 µL
milliQ 33 µL
上記の分量を混合した。
(2)PCR反応条件
<1>×1 Pre-denature 94 ℃ 2 min
<2>×35 Denature 94 ℃ 15 sec
Annealing 50.5 ℃ 30 sec
Extension 68 ℃ 1 min 40 sec
<3> 4℃ ∞
上記の条件でPCRを行った。
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
9月12日(月)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】←ぷろとこるのテーブルをコピペする!!
(1)PCR反応液の調製
<1本分あたり>
KOD+ polymelase 1 µL
10 x Buffer 2 µL
dNTP(2.0 µM) 5 µL
F primer(10 µM) 1.5 µL
R primer(10 µM) 1.5 µL
Templet DNA 1 µL
milliQ 33 µL
上記の分量を混合した。
*<プライマーの塩基配列>
・DIAP2
F primer : Tm値
GCTTCTCGATTGACGGAGCTGGGCATGGAGCT 62 ℃
R primer :
GCCGTCTAGATCACGAAAGGAACGTGCGCA 66.4 ℃
増幅サイズ 約1514 bp
(2)PCR反応条件
<1>×1 Pre-denature 94 ℃ 2 min
<2>×35 Denature 94 ℃ 15 sec
Annealing 50.5 ℃ 30 sec
Extension 68 ℃ 1 min 40 sec
<3> 4℃ ∞
上記の条件でPCRを行った。
9月13日(火)
松浪、横井川
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
9月14日(水)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験操作】
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*プライマーの塩基配列
・API2-MALT1
F primer
GCCGCTCGAGAACATAGTAGAAAACAGCAT
Tm値
57.8 ゜C
R primer
GCCGGCTAGCTCATTTTTCAGAAATTCTGA
Tm値
56.5 ゜C
増幅サイズ 約3131 bp
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
9月15日(木)
松浪、横井川
【目的】
cDNA vectorを鋳型としたcDNAの増殖
【実験方法】
以下の条件でPCRを行った。
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各サンプルを回収し、-20゜Cで保存した。
*<プライマーの塩基配列>
・DIAP2
F primer : Tm値
GCTTCTCGATTGACGGAGCTGGGCATGGAGCT 62 ℃
R primer :
GCCGTCTAGATCACGAAAGGAACGTGCGCA 66.4 ℃
増幅サイズ 約1514 bp
【目的】
PCR産物の確認
【実験操作】
PCR反応液 | 2 µl |
ddH2O | 8 µl |
6 x loading dye | 2 µl |
EtBr染色を行い、写真を撮った。
【目的】
PCR産物の制限酵素処理
【実験操作】
↓PCR産物を400 µlまでddH2Oで薄めた。
↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした。
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。
↓水層のみを新しいチューブに移した。
↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした。
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。
↓水層のみを新しいチューブに移した。
↓3M CH3COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した。
↓15000rpm、4°Cで10min遠心した。
↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた。
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した。
↓上澄みを捨て、乾燥させた。
↓ddH2Oを44 µl加えてvoltexした。
下記の組成に従って反応液を調整した。
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9月16日(金)
松浪、横井川
【目的】
PCR産物の制限酵素処理
【実験操作】
↓PCR産物を400 µlまでddH2Oで薄めた。
↓phenol-choloroform(φOH/CIAA)を400 µl加えてvoltexした。
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。
↓水層のみを新しいチューブに移した。
↓choloroform(CIAA)を等量加えてvoltexした。
↓10000rpm、4°Cで2~3min遠心した。
↓水層のみを新しいチューブに移した。
↓3M CH3COONa(pH 5.27)を1/10量、100% ethanolを3倍量加えて、2~3min静置した。
↓15000rpm、4°Cで10min遠心した。
↓上澄みを捨て、70% ethanol(EtOH)を200 µl加えた。
↓15000rpm、4°Cで5min遠心した。
↓上澄みを捨て、乾燥させた。
↓ddH2Oを44 µl加えてvoltexした。
下記の組成に従って反応液を調整した。