Team:KIT-Kyoto/れおぽん実験9月

From 2011.igem.org

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【実験方法】<br>
【実験方法】<br>
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以下の条件でPCRを行った。<BR>
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以下の2条件で各1サンプルずつPCRを行った。<BR>
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<table border="0"><tr><td>
<table border="0" width="150px">
<table border="0" width="150px">
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<tr><td align=center>PCR条件</td></tr>
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<tr><td align=center>PCR条件(1)</td></tr>
</table>
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<table border=1 width="250px">
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回収し、-20゜Cで保存した。
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<tr><td align=center>PCR条件(2)</td></tr>
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</table>
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<table border=1 width="250px">
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<tr><td width="150px" align=center>10 µM Flag-MLF Primer F</td><td width="100px"  align=right>1.5 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>10 µM Flag-MLF Primer R</td><td align=right>1.5 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>鋳型 DNA</td><td align=right>1 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>10 x PCR Buffer for KOD Plus</td><td align=right>5 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>dNTPs</td><td align=right>4 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>MgSO<sub>4</sub></td><td align=right>2 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>ddH<sub>2</sub>O</td><td align=right>34 µl</td></tr>
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<tr><td align=center>KOD Plus</td><td align=right>1 µl</td></tr>
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<tr><td>&nbsp;</td><td align=right>全量 50 µl</td></tr>
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</table>
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</td><TD></TD><TD></TD><td>
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<tr><td align=center>Cycle条件</td></tr>
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<tr><td width="100px" align=center>Start</td><td width="200px"  align=right>95°C、30秒</td></tr>
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<tr><td align=center rowspan=3>Cycle x 30</td><td align=right>95°C、30秒(熱変性)</td></tr>
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<tr><td align=right>(Tm-5)°C、1分(アニーリング)</td></tr>
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<tr><td align=right>68°C、1kb/分(伸長)</td></tr>
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<tr><td align=center>End</td><td align=right>4°Cで保持</td></tr>
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</td></tr>
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各サンプルを回収し、-20゜Cで保存した。
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【実験方法】<br>
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【結果】<br>
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【考察】<br>
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Revision as of 12:28, 20 September 2011

9/6(火)

吉村、中川

プライマー設計
【目的】
pUAST Fiag-tag dMLFからFiag-tag dMLFを単離・増殖させる。

【実験方法】
pUAST Fiag-tag dMLFからの Fiag-tag dMLFの上流にEcoRⅠ、XbaⅠの制限酵素サイト、下流にSpeⅠ、Pst Ⅰの制限酵素サイトがあるようにプライマー設計をした。


【実験結果】
F:AAAGAATTCAAATCTAGAAAAATGGACTACAAGGACGA
     EcoRⅠ    Xba
Tm値:72.14℃ 38塩基

R:AAACTGCAGAAAACTAGTAAATACCCTACTTCTTCTTGCC
     PstⅠ     Spe
Tm値:72.16℃ 40塩基


9/12(月)

吉村、中川


PCR
【目的】
9/6に作製したプライマーを用いてをFlag-tag dMLFを増幅させる

【実験方法】
以下の2条件で各1サンプルずつPCRを行った。

PCR条件(1)
10 µM Flag-MLF Primer F1.5 µl
10 µM Flag-MLF Primer R1.5 µl
鋳型 DNA1 µl
10 x PCR Buffer for KOD Plus5 µl
dNTPs4 µl
MgSO44 µl
ddH2O32 µl
KOD Plus1 µl
 全量 50 µl
Cycle条件
Start95°C、30秒
Cycle x 3095°C、30秒(熱変性)
(Tm-5)°C、1分(アニーリング)
68°C、1kb/分(伸長)
End4°Cで保持

PCR条件(2)
10 µM Flag-MLF Primer F1.5 µl
10 µM Flag-MLF Primer R1.5 µl
鋳型 DNA1 µl
10 x PCR Buffer for KOD Plus5 µl
dNTPs4 µl
MgSO42 µl
ddH2O34 µl
KOD Plus1 µl
 全量 50 µl
Cycle条件
Start95°C、30秒
Cycle x 3095°C、30秒(熱変性)
(Tm-5)°C、1分(アニーリング)
68°C、1kb/分(伸長)
End4°Cで保持

各サンプルを回収し、-20゜Cで保存した。

【結果】
アガロースゲル電気泳動に続く


9/13(火)

吉村

アガロースゲル電気泳動
【目的】

【実験方法】

【結果】

【考察】