Team:Arizona State/Templates/cas table
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| || cas_HTH || || || || || || || || || || || || || || || || || || || || | | || cas_HTH || || || || || || || || || || || || || || || || || || || || | ||
|- | |- | ||
- | |cas1 || cas1 || cas1 || y || y || y || y || y || y || y || y || y || y || || || || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1518}} || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|00287}} || || || Nuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref| | + | |cas1 || cas1 || cas1 || y || y || y || y || y || y || y || y || y || y || || || || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1518}} || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|00287}} || || || Nuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|65}} || |
|- | |- | ||
- | | rowspan="3"| cas10 || cmr2 || || || || || || || || || || y || y || || || || rowspan="4"| {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|02577}} || || y || rowspan="3"| Polymerase {{:Team:Arizona State/Templates/ref| | + | | rowspan="3"| cas10 || cmr2 || || || || || || || || || || y || y || || || || rowspan="4"| {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1353}} || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|02577}} || || y || rowspan="3"| Polymerase {{:Team:Arizona State/Templates/ref|65}} || |
|- | |- | ||
| csm1 || || || || || || || || || || y || y || || || || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|02578}} || || y || | | csm1 || || || || || || || || || || y || y || || || || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|02578}} || || y || | ||
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|cas3'' || || || y || y || || || || || || || || || || || || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|2254}} || || || || || | |cas3'' || || || y || y || || || || || || || || || || || || {{:Team:Arizona State/Templates/cog|2254}} || || || || || | ||
|- | |- | ||
- | | rowspan="2"| cas4 || cas4 || || y || y || y || y || || || || y || || || || || || rowspan="2"| {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1468}} || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|00372}} || || || rowspan="2"| RecB exonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref| | + | | rowspan="2"| cas4 || cas4 || || y || y || y || y || || || || y || || || || || || rowspan="2"| {{:Team:Arizona State/Templates/cog|1468}} || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|00372}} || || || rowspan="2"| RecB exonuclease {{:Team:Arizona State/Templates/ref|65}}{{:Team:Arizona State/Templates/ref|8}} || |
|- | |- | ||
| csa1 || || y || y || y || y || || || || y || || || || || || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|01896}} || || || | | csa1 || || y || y || y || y || || || || y || || || || || || {{:Team:Arizona State/Templates/tigr|01896}} || || || |
Latest revision as of 01:59, 29 September 2011
Name [65] | Name [15] | Name[25] | I-A | I-B | I-C | I-D | I-E | I-F | II-A | II-B | III-A | III-B | I-U | III-U | U | COG | TIGR | Ramp [65] | cascade-like complex [65] | putative function | grouping [75] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
cas_HTH | |||||||||||||||||||||
cas1 | cas1 | cas1 | y | y | y | y | y | y | y | y | y | y | 1518 | 00287 | Nuclease [65] | ||||||
cas10 | cmr2 | y | y | 1353 | 02577 | y | Polymerase [65] | ||||||||||||||
csm1 | y | y | 02578 | y | |||||||||||||||||
csx11 | y | y | y | ||||||||||||||||||
cas10d | csc3 | y | y | ||||||||||||||||||
cas2 | cas2 | cas2 | y | y | y | y | y | y | y | y | y | y | 1343, 3512 | 01573 | |||||||
cas3' | cas3 | cas3 | y | y | y | y | y | y | 1203 | 01587 | Helicase, nuclease [15] | ||||||||||
cas3 | y | y | 2254 | ||||||||||||||||||
cas4 | cas4 | y | y | y | y | y | 1468 | 00372 | RecB exonuclease [65][8] | ||||||||||||
csa1 | y | y | y | y | y | 01896 | |||||||||||||||
cas5 | cas5d | casD | y | y | y | y | 1688 | 01876 | y | y | N-terminal domain [15], crRNA processing [65] | cas5 | |||||||||
cas5e | y | y | y | y | 01868 | y | y | cas5 | |||||||||||||
cas5h | y | y | y | y | 02592 | y | y | cas5 | |||||||||||||
cas5t | y | y | y | y | 01895 | y | y | cas5 | |||||||||||||
cmx5 | y | y | y | y | y | y | cas5 | ||||||||||||||
csa5a | y | y | y | y | 01874 | y | y | cas5 | |||||||||||||
cas6 | cas6 | y | y | y | y | y | 1583, 5551 | 01877 | y | crRNA processing [65] | cas6 | ||||||||||
cmx6 | y | y | y | y | y | y | cas6 | ||||||||||||||
cas6e | cse3 | casE | y | 01907 | y | cas6 | |||||||||||||||
cas6f | csy4 | y | 02563 | y | cas6 | ||||||||||||||||
cas7 | csa2 | casC | y | y | y | y | 1857, 3649 | 02583 | y | y | Regulation [15] | cas7 | |||||||||
csd2 | y | y | y | y | 02589 | y | y | cas7 | |||||||||||||
cse4 | y | y | y | y | 01869 | y | y | cas7 | |||||||||||||
csh2 | y | y | y | y | 02590 | y | y | cas7 | |||||||||||||
cst2 | y | y | y | y | 02585 | y | y | cas7 | |||||||||||||
cas8a1 | CXXC-CXXC | y | y | ||||||||||||||||||
cmx1 | y | y | |||||||||||||||||||
cst1 | y | 01908 | y | ||||||||||||||||||
csx13 | y | y | |||||||||||||||||||
csx8 | y | y | |||||||||||||||||||
cas8a2 | csa4 | y | 01914 | y | |||||||||||||||||
csx9 | y | y | |||||||||||||||||||
cas8b | TM1802 | y | y | ||||||||||||||||||
csh1 | y | 02591 | y | ||||||||||||||||||
cas8c | csd1 | y | 01863 | y | |||||||||||||||||
csp2 | y | y | |||||||||||||||||||
cas9 | csn1 | y | y | 3513 | 01865 | HNH endonuclease [15] | |||||||||||||||
csx12 | y | y | |||||||||||||||||||
cmr1 | cmr1 | y | 1367 | 01894 | y | y | cas7 | ||||||||||||||
cmr3 | cmr3 | y | 1769 | 01888 | y | y | cas5 | ||||||||||||||
cmr4 | cmr4 | y | 1336 | 02580 | y | y | cas7 | ||||||||||||||
cmr5 | cmr5 | y | 3337 | 01881 | y | ||||||||||||||||
cmr6 | cmr6 | y | 1604 | 01898 | y | y | cas7 | ||||||||||||||
csa5 | csa5 | y | 01878 | y | |||||||||||||||||
csaX | csaX | y | 03876 | ||||||||||||||||||
csb1 | GSU0053 | y | y | ||||||||||||||||||
csb2 | y | y | |||||||||||||||||||
csb3 | y | y | |||||||||||||||||||
csc1 | csc1 | y | y | cas5 | |||||||||||||||||
csc2 | csc2 | 1337 | y | y | cas7 | ||||||||||||||||
cse1 | cse1 | casA | y | 02547 | y | ||||||||||||||||
cse2 | cse2 | casB | y | 02548 | y | ||||||||||||||||
csf1 | csf1 | y | |||||||||||||||||||
csf2 | csf2 | y | y | cas7 | |||||||||||||||||
csf3 | csf3 | y | y | ||||||||||||||||||
csf4 | csf4 | y | |||||||||||||||||||
csm2 | csm2 | y | 01870 | y | |||||||||||||||||
csm3 | csc2 | y | 1337 | y | y | cas7 | |||||||||||||||
csm3 | y | y | y | cas7 | |||||||||||||||||
csm4 | csm4 | y | 1567 | 01903 | y | y | cas5 | ||||||||||||||
csm5 | csm5 | y | 1332 | 01899 | y | y | cas7 | ||||||||||||||
csm6 | APE2256 | y | 1517 | transcription regulation [65] | |||||||||||||||||
csm6 | y | 02672 | |||||||||||||||||||
csn2 | csn2 | y | 01866 | ||||||||||||||||||
csx1 | DXTHG | y | 1517, 4006 | Helix-turn-helix, transcription regulation [15] | |||||||||||||||||
NE0113 | y | ||||||||||||||||||||
TIGR02710 | y | ||||||||||||||||||||
csa3 | y | 01884 | |||||||||||||||||||
csx1 | y | ||||||||||||||||||||
csx2 | y | ||||||||||||||||||||
csx10 | csx10 | y | y | ||||||||||||||||||
csx14 | y | ||||||||||||||||||||
csx15 | |||||||||||||||||||||
csx16 | VVA1548 | y | |||||||||||||||||||
csx17 | y | ||||||||||||||||||||
csx3 | csx3 | y | |||||||||||||||||||
csy1 | csy1 | y | 02564 | y | |||||||||||||||||
csy2 | csy2 | y | 02565 | y | y | cas5 | |||||||||||||||
csy3 | csy3 | y | 02566 | y | cas7 |