BLASTN 2.2.25+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. RID: Z3TN8VK9111 Query= 1558332 30F Length=1116 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) 1982 0.0 ALIGNMENTS >lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) Length=1785 Score = 1982 bits (1073), Expect = 0.0 Identities = 1095/1110 (99%), Gaps = 4/1110 (0%) Strand=Plus/Plus Query 8 ATTTGGTGTTC-AGATCGCTTGTTC-AAGATAACGCTACCGGGAAGGTTCTTGCTTCCCG 65 ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 58 ATTTGGTGTTCTCGATCGCTTGTTCAAAGATAACGCTACCGGGAAGGTTCTTGCTTCCCG 117 Query 66 GGTAGCTGTCGTAATTCTTTTGTTTATAATGGCGATTGTTTGGTATAGGGGAGATAGTTT 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 118 GGTAGCTGTCGTAATTCTTTTGTTTATAATGGCGATTGTTTGGTATAGGGGAGATAGTTT 177 Query 126 CTTTGAGTACTATAAGCAATCAAAGTATGAAACATACAGTGAAATTATTGAAAAGGAAAG 185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 178 CTTTGAGTACTATAAGCAATCAAAGTATGAAACATACAGTGAAATTATTGAAAAGGAAAG 237 Query 186 AACTGCACGCTTTGAATCTGTCGCCCTGGAACAACTCCAGATAGTTCATATATCATCTGA 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 238 AACTGCACGCTTTGAATCTGTCGCCCTGGAACAACTCCAGATAGTTCATATATCATCTGA 297 Query 246 GGCAGACTTTAGTGCGGTGTATTCTTTCCGCCCTAAAAACTTAAACTATTTTGTTGATAT 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 298 GGCAGACTTTAGTGCGGTGTATTCTTTCCGCCCTAAAAACTTAAACTATTTTGTTGATAT 357 Query 306 TATAGCATACGAAGGAAAATTACCTTCAACAATAAGTGAAAAATCACTTGGAGGATATCC 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 358 TATAGCATACGAAGGAAAATTACCTTCAACAATAAGTGAAAAATCACTTGGAGGATATCC 417 Query 366 TGTTGATAAAACTATGGATGAATATACAGTTCATTTAAATGGACGTCATTATTATTCCAA 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 TGTTGATAAAACTATGGATGAATATACAGTTCATTTAAATGGACGTCATTATTATTCCAA 477 Query 426 CTCAAAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCCTACTCCCGAAATAAACTACATGTACAG 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 478 CTCAAAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCCTACTCCCGAAATAAACTACATGTACAG 537 Query 486 TTGTCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGCTGGAACGATAACCATGTACTGGTATAG 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 TTGTCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGCTGGAACGATAACCATGTACTGGTATAG 597 Query 546 AAATGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATCAATATGTGCTCAGGCGGCCAGAATATT 605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 AAATGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATCAATATGTGCTCAGGCGGCCAGAATATT 657 Query 606 AGGAAGGGCTAAATAATTA-ACTAGA-ATACTTAGGAGGTATTATGAATATATTTGAAAT 663 ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 AGGAAGGGCTAAATAATTATACTAGAGATACTTAGGAGGTATTATGAATATATTTGAAAT 717 Query 664 GTTACGTATAGATGAAGGTCTTAGACTTAAAATCTATAAAGACACAGAAGGCTATTACAC 723 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 GTTACGTATAGATGAAGGTCTTAGACTTAAAATCTATAAAGACACAGAAGGCTATTACAC 777 Query 724 TATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCCATCACTTAATGCTGCTAAATCTGAATT 783 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 TATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCCATCACTTAATGCTGCTAAATCTGAATT 837 Query 784 AGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGTAATTACAAAAGATGAGGCTGAAAAACT 843 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 AGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGTAATTACAAAAGATGAGGCTGAAAAACT 897 Query 844 CTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGGAATCCTGAGAAATGCTAAATTAAAACC 903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 CTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGGAATCCTGAGAAATGCTAAATTAAAACC 957 Query 904 GGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATTAATATGGTTTTCCAAAT 963 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 GGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATTAATATGGTTTTCCAAAT 1017 Query 964 GGGANAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTCTTTACGTATGCTTCAACAAAAACGCTG 1023 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 GGGAGAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTCTTTACGTATGCTTCAACAAAAACGCTG 1077 Query 1024 GGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAANAGTAGATGGNNTAATCAAACNCCTAATCnnnn 1083 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 1078 GGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAAAAGTAGATGGTATAATCAAACACCTAATCGCGC 1137 Query 1084 aaaaCGAGTCATTACAACGTTTANAACTGG 1113 ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1138 AAAACGAGTCATTACAACGTTTAGAACTGG 1167 Query= 1558333 440F Length=1135 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) 2001 0.0 ALIGNMENTS >lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) Length=1785 Score = 2001 bits (1083), Expect = 0.0 Identities = 1112/1133 (98%), Gaps = 5/1133 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4 ATTCCNACTC-AAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCCTACTCCCGAAATAAACTACA 62 ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 471 ATTCCAACTCAAAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCCTACTCCCGAAATAAACTACA 530 Query 63 TGTACAGTTGTCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGCTGGAACGATAACCATGTACT 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 531 TGTACAGTTGTCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGCTGGAACGATAACCATGTACT 590 Query 123 GGTATAGAAATGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATCAATATGTGCTCAGGCGGCCA 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 591 GGTATAGAAATGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATCAATATGTGCTCAGGCGGCCA 650 Query 183 GAATATTAGGAAGGGCTAAATAATTA-ACTAGA-ATACTTAGGAGGTATTATGAATATAT 240 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 651 GAATATTAGGAAGGGCTAAATAATTATACTAGAGATACTTAGGAGGTATTATGAATATAT 710 Query 241 TTGAAATGTTACGTATAGATGAAGGTCTTAGACTTAAAATCTATAAAGACACAGAAGGCT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 711 TTGAAATGTTACGTATAGATGAAGGTCTTAGACTTAAAATCTATAAAGACACAGAAGGCT 770 Query 301 ATTACACTATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCCATCACTTAATGCTGCTAAAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 771 ATTACACTATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCCATCACTTAATGCTGCTAAAT 830 Query 361 CTGAATTAGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGTAATTACAAAAGATGAGGCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 831 CTGAATTAGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGTAATTACAAAAGATGAGGCTG 890 Query 421 AAAAACTCTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGGAATCCTGAGAAATGCTAAAT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 891 AAAAACTCTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGGAATCCTGAGAAATGCTAAAT 950 Query 481 TAAAACCGGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATTAATATGGTTT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 951 TAAAACCGGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATTAATATGGTTT 1010 Query 541 TCCAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTCTTTACGTATGCTTCAACAAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1011 TCCAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTCTTTACGTATGCTTCAACAAA 1070 Query 601 AACGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAAAAGTAGATGGTATAATCAAACACCTA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1071 AACGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAAAAGTAGATGGTATAATCAAACACCTA 1130 Query 661 ATCGCGCAAAACGAGTCATTACAACGTTTAGAACTGGCACTTGGGACGCGTATAANAATC 720 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1131 ATCGCGCAAAACGAGTCATTACAACGTTTAGAACTGGCACTTGGGACGCGTATAAAAATC 1190 Query 721 TATAAAGC-ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCC 779 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1191 TATAAAGCTACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCC 1250 Query 780 TTTCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCTACTAGAGTCACACTGGCTCACCT 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1251 TTTCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCTACTAGAGTCACACTGGCTCACCT 1310 Query 840 TCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTTATATACTAGAGTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGACT 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1311 TCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTTATATACTAGAGTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGACT 1370 Query 900 ATGCTAGCTACTAGAG-ATAGGAGGCCTTTATGGCCTTAAAAGCAACAGCACTTTTTGCC 958 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1371 ATGCTAGCTACTAGAGGATAGGAGGCCTTTATGGCCTTAAAAGCAACAGCACTTTTTGCC 1430 Query 959 ATGCTAGGATTGTCATTTGTTTTATCTCCATCGATTGAAGCGAATGTCNATCCTCATTTT 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1431 ATGCTAGGATTGTCATTTGTTTTATCTCCATCGATTGAAGCGAATGTCGATCCTCATTTT 1490 Query 1019 GATAAATTTATGGAATCTGGNNTTAGGCACGTTTATNTGCTTTTTGaaaanaaaanCGTA 1078 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| Sbjct 1491 GATAAATTTATGGAATCTGGTATTAGGCACGTTTATATGCTTTTTGAAAATAAAAGCGTA 1550 Query 1079 NAATCNNCTGAACAATTCTATAGTTTTannnnaaCGACCTATAAAANTGACCC 1131 |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 1551 GAATCGTCTGAACAATTCTATAGTTTTATGAGAACGACCTATAAAAATGACCC 1603 Score = 161 bits (87), Expect = 4e-43 Identities = 87/87 (100%), Gaps = 0/87 (0%) Strand=Plus/Plus Query 729 ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTT 788 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1699 ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTT 1758 Query 789 ATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTC 815 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1759 ATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTC 1785 Query= 1558334 947F Length=1095 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) 1328 0.0 ALIGNMENTS >lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) Length=1785 Score = 1328 bits (719), Expect = 0.0 Identities = 730/735 (99%), Gaps = 4/735 (1%) Strand=Plus/Plus Query 8 GCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATTAATATGGTTTTCCAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCA 67 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 977 GCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATTAATATGGTTTTCCAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCA 1036 Query 68 GGATTTACTAACTCTTTACGTATGCTTCAACAAAAACGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAAC 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1037 GGATTTACTAACTCTTTACGTATGCTTCAACAAAAACGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAAC 1096 Query 128 TTAGCTAAAAGTAGATGGTATAATCAAACACCTAATCGCGCAAAACGAGTCATTACAACG 187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1097 TTAGCTAAAAGTAGATGGTATAATCAAACACCTAATCGCGCAAAACGAGTCATTACAACG 1156 Query 188 TTTAGAACTGGCACTTGGGACGCGTATAAAAATCTATAAAGC-ACTAGAGCCAGGCATCA 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1157 TTTAGAACTGGCACTTGGGACGCGTATAAAAATCTATAAAGCTACTAGAGCCAGGCATCA 1216 Query 247 AATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGT 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1217 AATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGT 1276 Query 307 GAACGCTCTCTACTAGAGTCACACTGGCTCACCTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTTATAT 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1277 GAACGCTCTCTACTAGAGTCACACTGGCTCACCTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTTATAT 1336 Query 367 ACTAGAGTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGACTATGCTAGCTACTAGAG-ATAGGAGGC 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1337 ACTAGAGTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGACTATGCTAGCTACTAGAGGATAGGAGGC 1396 Query 426 CTTTATGGCCTTAAAAGCAACAGCACTTTTTGCCATGCTAGGATTGTCATTTGTTTTATC 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1397 CTTTATGGCCTTAAAAGCAACAGCACTTTTTGCCATGCTAGGATTGTCATTTGTTTTATC 1456 Query 486 TCCATCGATTGAAGCGAATGTCGATCCTCATTTTGATAAATTTATGGAATCTGGTATTAG 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1457 TCCATCGATTGAAGCGAATGTCGATCCTCATTTTGATAAATTTATGGAATCTGGTATTAG 1516 Query 546 GCACGTTTATATGCTTTTTGAAAATAAAAGCGTAGAATCGTCTGAACAATTCTATAGTTT 605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1517 GCACGTTTATATGCTTTTTGAAAATAAAAGCGTAGAATCGTCTGAACAATTCTATAGTTT 1576 Query 606 TATGAGAACGACCTATAAAAATGACCCGTGCTCTTCTGATTTTGAATGTATAGAGCGAGG 665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1577 TATGAGAACGACCTATAAAAATGACCCGTGCTCTTCTGATTTTGAATGTATAGAGCGAGG 1636 Query 666 CGCGGAGATGGCACAATCATACGCTAGAATTATGAACATTAAATTGGAGACTGAATGANA 725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1637 CGCGGAGATGGCACAATCATACGCTAGAATTATGAACATTAAATTGGAGACTGAATGAAA 1696 Query 726 T-ACTAGAGCC-GGC 738 | ||||||||| ||| Sbjct 1697 TTACTAGAGCCAGGC 1711 Score = 161 bits (87), Expect = 4e-43 Identities = 87/87 (100%), Gaps = 0/87 (0%) Strand=Plus/Plus Query 230 ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTT 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1699 ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTT 1758 Query 290 ATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTC 316 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1759 ATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTC 1785 Query= 1558335 1289F Length=1130 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) 701 0.0 ALIGNMENTS >lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) Length=1785 Score = 701 bits (379), Expect = 0.0 Identities = 395/403 (98%), Gaps = 5/403 (1%) Strand=Plus/Plus Query 3 CTTC-GGNGGG-CTTTCTGNGTTTATATANTAGAGTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGA 60 |||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1309 CTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTTATATACTAGAGTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGA 1368 Query 61 CTATGCTAGCTACTAGA-GATAGGAGGCCTTTATGGCCTTAAAAGCAACAGCACTTTTTG 119 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1369 CTATGCTAGCTACTAGAGGATAGGAGGCCTTTATGGCCTTAAAAGCAACAGCACTTTTTG 1428 Query 120 CCATGCTAGGATTGTCATTTGTTTTATCTCCATCGATTGAAGCGAATGTCGATCCTCATT 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1429 CCATGCTAGGATTGTCATTTGTTTTATCTCCATCGATTGAAGCGAATGTCGATCCTCATT 1488 Query 180 TTGATAAATTTATGGAATCTGGTATTAGGCACGTTTATATGCTTTTTGAAAATAAAAGCG 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1489 TTGATAAATTTATGGAATCTGGTATTAGGCACGTTTATATGCTTTTTGAAAATAAAAGCG 1548 Query 240 TAGAATCGTCTGAACAATTCTATAGTTTTATGAGAACGACCTATAAAAATGACCCGTGCT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1549 TAGAATCGTCTGAACAATTCTATAGTTTTATGAGAACGACCTATAAAAATGACCCGTGCT 1608 Query 300 CTTCTGATTTTGAATGTATAGAGCGAGGCGCGGAGATGGCACAATCATACGCTAGAATTA 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1609 CTTCTGATTTTGAATGTATAGAGCGAGGCGCGGAGATGGCACAATCATACGCTAGAATTA 1668 Query 360 TGAACATTAAATTGGAGACTGAATGAAAT-ACTAGAGCC-GGC 400 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct 1669 TGAACATTAAATTGGAGACTGAATGAAATTACTAGAGCCAGGC 1711 Query= 1558336 816R Length=1115 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) 1343 0.0 ALIGNMENTS >lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) Length=1785 Score = 1343 bits (727), Expect = 0.0 Identities = 741/748 (99%), Gaps = 4/748 (1%) Strand=Plus/Plus Query 368 CTTAAAAGGAGGGTCTATGGCAGCACCTAGAATATCATNTTCGCCCTCTGATATTCTATT 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CTTAAAAGGAGGGTCTATGGCAGCACCTAGAATATCATTTTCGCCCTCTGATATTCTATT 60 Query 428 TGGTGTTCTAGATCGCTTGTTCAAAGATAACGCTACCGGGAAGGTTCTTGCTTCCCGGGT 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TGGTGTTCTCGATCGCTTGTTCAAAGATAACGCTACCGGGAAGGTTCTTGCTTCCCGGGT 120 Query 488 AGCTGTCGTAATTCTTTTGTTTATAATGGCGATTGTTTGGTATAGGGGAGATAGTTTCTT 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGCTGTCGTAATTCTTTTGTTTATAATGGCGATTGTTTGGTATAGGGGAGATAGTTTCTT 180 Query 548 TGAGTACTATAAGCAATCAAAGTATGAAACATACAGTGAAATTATTGAAAAGGAAAGAAC 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TGAGTACTATAAGCAATCAAAGTATGAAACATACAGTGAAATTATTGAAAAGGAAAGAAC 240 Query 608 TGCACGCTTTGAATCTGTCGCCCTGGAACAACTCCAGATAGTTCATATATCATCTGAGGC 667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TGCACGCTTTGAATCTGTCGCCCTGGAACAACTCCAGATAGTTCATATATCATCTGAGGC 300 Query 668 AGACTTTAGTGCGGTGTATTCTTTCCGCCCTAAAAACTTAAACTATTTTGTTGATATTAT 727 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AGACTTTAGTGCGGTGTATTCTTTCCGCCCTAAAAACTTAAACTATTTTGTTGATATTAT 360 Query 728 AGCATACGAAGGAAAATTACCTTCAACAATAAGTGAAAAATCACTTGGAGGATATCCTGT 787 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AGCATACGAAGGAAAATTACCTTCAACAATAAGTGAAAAATCACTTGGAGGATATCCTGT 420 Query 788 TGATAAAACTATGGATGAATATACAGTTCATTTAAATGGACGTCATTATTATTCCAACTC 847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TGATAAAACTATGGATGAATATACAGTTCATTTAAATGGACGTCATTATTATTCCAACTC 480 Query 848 AAAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCCTACTCCCGAAATAAACTACATGTACAGTTG 907 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AAAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCCTACTCCCGAAATAAACTACATGTACAGTTG 540 Query 908 TCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGCTGGAACGATAACCATGTACTGGTATAGAAA 967 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGCTGGAACGATAACCATGTACTGGTATAGAAA 600 Query 968 TGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATCAATATGTGCTCAGGCGGCCAGAATATTAGG 1027 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATCAATATGTGCTCAGGCGGCCAGAATATTAGG 660 Query 1028 AAGGGCTAAATAATTA-ACTAGA-ATACTTAGGAGGTATTATGAATATATTTGAAATGTT 1085 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AAGGGCTAAATAATTATACTAGAGATACTTAGGAGGTATTATGAATATATTTGAAATGTT 720 Query 1086 ACGTATAGATNAAGGTCT-AGACT-AAA 1111 |||||||||| ||||||| ||||| ||| Sbjct 721 ACGTATAGATGAAGGTCTTAGACTTAAA 748 Query= 1558337 1333R Length=1160 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) 1962 0.0 ALIGNMENTS >lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) Length=1785 Score = 1962 bits (1062), Expect = 0.0 Identities = 1087/1105 (98%), Gaps = 4/1105 (0%) Strand=Plus/Plus Query 55 GATTGTTT-GTNTAGGGGAGATAGTTTNTTTGAGTACNATAAGCAATCAAAGTNTGAAAC 113 |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 151 GATTGTTTGGTATAGGGGAGATAGTTTCTTTGAGTACTATAAGCAATCAAAGTATGAAAC 210 Query 114 ATCCAGNGAAATTATTGAAAAGGAAANAACTGCACNCTTTGAATCTNTNGCCCTGGAACA 173 || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| Sbjct 211 ATACAGTGAAATTATTGAAAAGGAAAGAACTGCACGCTTTGAATCTGTCGCCCTGGAACA 270 Query 174 ACTCCAGATAGTTCATATNTCATNTGAGGCAGACTTTAGTGCGGTGTATTCTNTCCGCCC 233 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 271 ACTCCAGATAGTTCATATATCATCTGAGGCAGACTTTAGTGCGGTGTATTCTTTCCGCCC 330 Query 234 TAAAAACTTAAACTATTTTGTTGATATTATAGCATACGAAGGAAAATTACCTTCAACAAT 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 331 TAAAAACTTAAACTATTTTGTTGATATTATAGCATACGAAGGAAAATTACCTTCAACAAT 390 Query 294 AAGTGAAAAATCACTTGGAGGATATCCTGTTGATAAAACTATGGATGAATATACAGTTCA 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 391 AAGTGAAAAATCACTTGGAGGATATCCTGTTGATAAAACTATGGATGAATATACAGTTCA 450 Query 354 TTTAAATGGACGTCATTATTATTCCAACTCAAAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCC 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 451 TTTAAATGGACGTCATTATTATTCCAACTCAAAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCC 510 Query 414 TACTCCCGAAATAAACTACATGTACAGTTGTCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGC 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 511 TACTCCCGAAATAAACTACATGTACAGTTGTCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGC 570 Query 474 TGGAACGATAACCATGTACTGGTATAGAAATGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATC 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 571 TGGAACGATAACCATGTACTGGTATAGAAATGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATC 630 Query 534 AATATGTGCTCAGGCGGCCAGAATATTAGGAAGGGCTAAATAATTA-ACTAGA-ATACTT 591 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct 631 AATATGTGCTCAGGCGGCCAGAATATTAGGAAGGGCTAAATAATTATACTAGAGATACTT 690 Query 592 AGGAGGTATTATGAATATATTTGAAATGTTACGTATAGATGAAGGTCTTAGACTTAAAAT 651 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 691 AGGAGGTATTATGAATATATTTGAAATGTTACGTATAGATGAAGGTCTTAGACTTAAAAT 750 Query 652 CTATAAAGACACAGAAGGCTATTACACTATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCC 711 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 751 CTATAAAGACACAGAAGGCTATTACACTATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCC 810 Query 712 ATCACTTAATGCTGCTAAATCTGAATTAGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGT 771 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 811 ATCACTTAATGCTGCTAAATCTGAATTAGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGT 870 Query 772 AATTACAAAAGATGAGGCTGAAAAACTCTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGG 831 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 871 AATTACAAAAGATGAGGCTGAAAAACTCTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGG 930 Query 832 AATCCTGAGAAATGCTAAATTAAAACCGGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTG 891 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 931 AATCCTGAGAAATGCTAAATTAAAACCGGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTG 990 Query 892 TGCATTGATTAATATGGTTTTCCAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTC 951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 991 TGCATTGATTAATATGGTTTTCCAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTC 1050 Query 952 TTTACGTATGCTTCAACAAAAACGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAAAAGTAG 1011 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1051 TTTACGTATGCTTCAACAAAAACGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAAAAGTAG 1110 Query 1012 ATGGTATAATCAAACACCTAATCGCGCAAAACGAGTCATTACAACGTTTAGAACTGGCAC 1071 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1111 ATGGTATAATCAAACACCTAATCGCGCAAAACGAGTCATTACAACGTTTAGAACTGGCAC 1170 Query 1072 TTGGGACGCGTATAAAAATCTATAAAGC-ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGG 1130 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1171 TTGGGACGCGTATAAAAATCTATAAAGCTACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGG 1230 Query 1131 CTCAGTCGAAAGACTGGGCCNTTCG 1155 |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1231 CTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCG 1255 Score = 100 bits (54), Expect = 9e-25 Identities = 55/56 (98%), Gaps = 0/56 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1100 ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCNTTCG 1155 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1699 ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCG 1754 Query= 1558338 1734R Length=1176 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) 2017 0.0 ALIGNMENTS >lcl|1059 BBa_K112808 Part-only sequence (1785 bp) Length=1785 Score = 2017 bits (1092), Expect = 0.0 Identities = 1135/1172 (97%), Gaps = 4/1172 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TCCAACTCAAAATTTNNTTTNTTNCCAACtaaaaannctnntcccgaaataaactnnang 60 ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||| | | Sbjct 473 TCCAACTCAAAATTTGCTTTTTTACCAACTAAAAAGCCTACTCCCGAAATAAACTACATG 532 Query 61 nnnagtnntccanntnttaatttggataannnntnnGCTGGAACGATAACCATGTACTGG 120 ||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 533 TACAGTTGTCCATATTTTAATTTGGATAATATCTATGCTGGAACGATAACCATGTACTGG 592 Query 121 TATAGAAATGATCANNNAAGTAATGACCNCCTTGAATCAATATGTGNTCAGGNGNCCAGA 180 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| Sbjct 593 TATAGAAATGATCATATAAGTAATGACCGCCTTGAATCAATATGTGCTCAGGCGGCCAGA 652 Query 181 ATATTAGGAAGGGCTAAATAATTA-ACTAGA-ATACTTAGGAGGTATTATGAATATATTT 238 |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 653 ATATTAGGAAGGGCTAAATAATTATACTAGAGATACTTAGGAGGTATTATGAATATATTT 712 Query 239 GAAATGTTACGTATAGATGAAGGTNTTAGACTTAAAATCTATAAAGACACAGAAGGCTAT 298 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 713 GAAATGTTACGTATAGATGAAGGTCTTAGACTTAAAATCTATAAAGACACAGAAGGCTAT 772 Query 299 TACACTATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCCATCACTTAATGCTGCTAAATCT 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 773 TACACTATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCCATCACTTAATGCTGCTAAATCT 832 Query 359 GAATTAGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGTAATTACAAAAGATGAGGCTGAA 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 833 GAATTAGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGTAATTACAAAAGATGAGGCTGAA 892 Query 419 AAACTCTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGGAATCCTGAGAAATGCTAAATTA 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 893 AAACTCTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGGAATCCTGAGAAATGCTAAATTA 952 Query 479 AAACCGGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATTAATATGGTTTTC 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 953 AAACCGGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATTAATATGGTTTTC 1012 Query 539 CAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTCTTTACGTATGCTTCAACAAAAA 598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1013 CAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTCTTTACGTATGCTTCAACAAAAA 1072 Query 599 CGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAAAAGTAGATGGTATAATCAAACACCTAAT 658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1073 CGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAAAAGTAGATGGTATAATCAAACACCTAAT 1132 Query 659 CGCGCAAAACGAGTCATTACAACGTTTAGAACTGGCACTTGGGACGCGTATAAAAATCTA 718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1133 CGCGCAAAACGAGTCATTACAACGTTTAGAACTGGCACTTGGGACGCGTATAAAAATCTA 1192 Query 719 TAAAGC-ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTT 777 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1193 TAAAGCTACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTT 1252 Query 778 TCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCTACTAGAGTCACACTGGCTCACCTTC 837 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1253 TCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCTACTAGAGTCACACTGGCTCACCTTC 1312 Query 838 GGGTGGGCCTTTCTGCGTTTATATACTAGAGTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGACTAT 897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1313 GGGTGGGCCTTTCTGCGTTTATATACTAGAGTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGACTAT 1372 Query 898 GCTAGCTACTAGAG-ATAGGAGGCCTTTATGGCCTTAAAAGCAACAGCACTTTTTGCCAT 956 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1373 GCTAGCTACTAGAGGATAGGAGGCCTTTATGGCCTTAAAAGCAACAGCACTTTTTGCCAT 1432 Query 957 GCTAGGATTGTCATTTGTTTTATCTCCATCGATTGAAGCGAATGTCGATCCTCATTTTGA 1016 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1433 GCTAGGATTGTCATTTGTTTTATCTCCATCGATTGAAGCGAATGTCGATCCTCATTTTGA 1492 Query 1017 TAAATTTATGGAATCTGGTATTAGGCACGTTTATATGCTTTTTGAAAATAAAAGCGTAGA 1076 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1493 TAAATTTATGGAATCTGGTATTAGGCACGTTTATATGCTTTTTGAAAATAAAAGCGTAGA 1552 Query 1077 ATCGTCTGAACAATTCTATAGTTTTATGAGAACGACCTATAAAAATGACCCGTGCTCTTC 1136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1553 ATCGTCTGAACAATTCTATAGTTTTATGAGAACGACCTATAAAAATGACCCGTGCTCTTC 1612 Query 1137 TGATTTTGAATGTATAGAGCGAGGCGCGGAGA 1168 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1613 TGATTTTGAATGTATAGAGCGAGGCGCGGAGA 1644 Score = 161 bits (87), Expect = 4e-43 Identities = 87/87 (100%), Gaps = 0/87 (0%) Strand=Plus/Plus Query 725 ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTT 784 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1699 ACTAGAGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTT 1758 Query 785 ATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTC 811 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1759 ATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTC 1785